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J-GLOBAL ID：202202262434462890   整理番号：22A1027028

骨リモデリングにおける機械的に応答性の長い非コードRNAを同定する四重項ネットワーク解析【JST・京大機械翻訳】

A Quartet Network Analysis Identifying Mechanically Responsive Long Noncoding RNAs in Bone Remodeling

著者 (12件)： Cai Jingyi (1State Key Laboratory of Oral Diseases and National Clinical Research Center for Oral Diseases, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Li Chaoyuan (2Department of Oral Implantology, Shanghai Engineering Research Center of Tooth Restoration and Regeneration, School and Hospital of Stomatology, Tongji University, Shanghai, China) ,  Li Shun (3Institute of Engineering Medicine, Beijing Institute of Technology, Beijing, China) ,  Yi Jianru (1State Key Laboratory of Oral Diseases and National Clinical Research Center for Oral Diseases, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Wang Jun (1State Key Laboratory of Oral Diseases and National Clinical Research Center for Oral Diseases, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Yao Ke (1State Key Laboratory of Oral Diseases and National Clinical Research Center for Oral Diseases, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Gan Xinyan (1State Key Laboratory of Oral Diseases and National Clinical Research Center for Oral Diseases, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Shen Yu (4School of Basic Medical Sciences, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Yang Pu (1State Key Laboratory of Oral Diseases and National Clinical Research Center for Oral Diseases, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Jing Dian (5Department of Orthodontics, China Shanghai Ninth People’s Hospital, College of Stomatology, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Jing Dian (6National Center for Stomatology, National Clinical Research Center for Oral Diseases, Shanghai Key Laboratory of Stomatology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Zhao Zhihe (1State Key Laboratory of Oral Diseases and National Clinical Research Center for Oral Diseases, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu, China)
資料名： Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (Web)  (Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (Web))
巻： 10  ページ： 780211  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7059A  ISSN： 2296-4185  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 機械力,すなわち,それは,しばしば,認可され,見落とされているので,現在,生体におけるそれらの重要な役割を裏付けている証拠の記録のために,スポットライトを得つつある。骨は,特に,歪および圧縮のようなマニホールド外力,および微小環境の流体せん断応力および物理的性質のような内因性手がかりを経験する。多様な背景で火花されたが,骨が受けるメカノトランスダクション過程に関する長い非コードRNA(lncRNA)は,系統的方法ではまだ詳細ではない。本研究の主目的は,生物物理学的環境応答のための骨関連細胞により適応される可能性のあるlncRNA集束機械的シグナル伝達系を強調することである。力感受性mRNAとmiRNAの信頼できるリストに基づいて,lncRNA同定のための力応答性競合内因性RNAネットワークを構築した。基礎となる機構を解明するために,著者らは,lncRNAとmRNAの間の可能なクロストーク,ならびに転写因子とマッピングされたlncRNAを,骨リモデリングとメカノトランスダクションに関与する既知のシグナル伝達経路に例証した。最後に,著者らは,予測と確立されたlncRNA間の結合解析を開発し,H19のような既知の因子の相互作用関係と新しい役割を示唆する経路-lncRNAネットワークを構築した。結論として,本研究は系統的四重ネットワーク解析を提供し,候補力関連lncRNAを明らかにし,おそらく関与する上流および下流プロセスの両方を強調した。配列データ,文献検索,および計算アルゴリズムを統合する生物情報学分析の新しいモードも紹介した。幸いことに,本研究は,機械的入力に直面するlncRNA世界の多重度と複雑性に対する明瞭度を提供するであろう。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *応答特性 ,  *ネットワーク ,  *骨 ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  環境 ,  生物物理学 ,  細胞情報伝達 ,  転写因子 ,  クロストーク
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  機械刺激細胞情報伝達 ,  バイオインフォマティクス ,  内因性 ,  微小環境 ,  非翻訳長鎖RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： メカノトランスダクション ,  長鎖非コードRNA(lncRNA) ,  競合する内因性RNA(ceRNA) ,  転写因子(TF) ,  骨 ,  間葉系幹細胞(MSCs) ,  マイクロRNA(miRNA) ,  力

分類 (4件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  筋骨格系・皮膚モデル  (EL02040R) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

引用文献 (144件)：

• AlamT., MedvedevaY. A., JiaH., BrownJ. B., LipovichL., BajicV. B. (2014). Promoter Analysis Reveals Globally Differential Regulation of Human Long Non-coding RNA and Protein-Coding Genes. PLoS One 9, e109443. doi: 10.1371/journal.pone.0109443
• AnH., TanJ. T., ShelkovnikovaT. A. (2019). Stress Granules Regulate Stress-Induced Paraspeckle Assembly. J. Cel Biol. 218, 4127-4140. doi: 10.1083/jcb.201904098
• AzzolinL., ZanconatoF., BresolinS., ForcatoM., BassoG., BicciatoS., et al (2012). Role of TAZ as Mediator of Wnt Signaling. Cell 151, 1443-1456. doi: 10.1016/j.cell.2012.11.027
• BettisT., KimB.-J., HamrickM. W. (2018). Impact of Muscle Atrophy on Bone Metabolism and Bone Strength: Implications for Muscle-Bone Crosstalk with Aging and Disuse. Osteoporos. Int. 29, 1713-1720. doi: 10.1007/s00198-018-4570-1
• BiH., WangD., LiuX., WangG., WuX. (2020). Long Non-coding RNA H19 Promotes Osteogenic Differentiation of Human Bone Marrow-Derived Mesenchymal Stem Cells by Regulating microRNA-140-5p/SATB2 axis. J. Biosci. 45. doi: 10.1007/s12038-020-0024-y

タイトルに関連する用語 (6件)： 骨リモデリング ,  応答性 ,  非コードRNA ,  同定 ,  四重項 ,  ネットワーク解析