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J-GLOBAL ID:202202263322352835   整理番号:22A1023328

Argentinaからのカルバペネマーゼ産生腸管外病原性大腸菌:クローン多様性と超エピデミッククローンCC10とCC131の優位性【JST・京大機械翻訳】

Carbapenemase-Producing Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli From Argentina: Clonal Diversity and Predominance of Hyperepidemic Clones CC10 and CC131
著者 (23件):
資料名:
巻: 13  ページ: 830209  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7080A  ISSN: 1664-302X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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腸管外病原性大腸菌(ExPEC)は腸外感染を引き起こす。クローン複合体(CC)/配列型(ST)131のような特別なExPECクローンはフルオロキノロンに対する染色体変異から開始する抗菌剤耐性を順次蓄積し,bla_CTX-M-15の獲得とより最近カルバペネマーゼの獲得が続くことが知られている。ここでは,2008年7月~2017年3月に回収した代表的な臨床分離株におけるArgentinaからのカルバペネマーゼ産生ExPECの世界的流行クローンの分布を調べた。カルバペネマーゼ産生ExPEC(n=160)をアルゼンチン参照研究所に参照した。これらのうち,71をゲノム配列決定のために選択した。表現型と微生物学的研究は,カルバペネムーゼの存在がKPC-2(n=52),NDM-1(n=16),IMP-8(n=2),およびVIM-1(n=1)生産者であることを確認した。分離株は,主に尿,血液,および腹部液から他の間で回収され,いくつかのものはスクリーニングサンプルからであった。病原性遺伝子含有量を分析した後,分離株の76%はExPECと考えられたが,非ExPEC分離株も腸外部位から得られた。Pan-ゲノム系統発生とクローン分析は,大きなクローン多様性を示したが,豊度の最初の系統群は,CC10分離株を有し,CC/ST131を有する系統群B2,主にH30Rx,サブクローン共産生CTX-M-15であった。また,Phylo群D,B1,C,F,およびEは,より少ない菌株で検出された。CC10とCC/ST131は国を通して見出された。さらに,CC10はNDM-1のようなほとんどの金属酵素を核形成した。他の関連する国際クローン,例えばCC/ST38,CC155,CC14/ST1193およびCC23を同定した。2つの分離株は,KPC-2とOXA-163またはOXA-439,OXA-163の点突然変異体,および3つの分離株が,他の耐性遺伝子の間でMCR-1を共産生した。結論として,本研究では,Argentinaにおけるカルバペネマーゼ産生ExPECの分子疫学について述べた。さらなる研究は,この領域におけるExPECにおけるカルバペネムーゼを切断するプラスミドファミリーを決定するために必要である。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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感染症・寄生虫症一般  ,  微生物感染の生理と病原性 
引用文献 (43件):
  • Aghapour Z., Gholizadeh P., Ganbarov K., Bialvaei A. Z., Mahmood S. S., Tanomand A., et al (2019). Molecular mechanisms related to colistin resistance in Enterobacteriaceae. Infect Drug Resist. 12 965-975. doi: 10.2147/IDR.S199844
  • Argimon S., Abudahab K., Goater R. J. E., Fedosejev A., Bhai J., Glasner C., et al (2016). Microreact: visualizing and sharing data for genomic epidemiology and phylogeography. Microb. Genom. 2:e000093. doi: 10.1099/mgen.0.000093
  • Beghain J., Bridier-Nahmias A., Le Nagard H., Denamur E., Clermont O. (2018). ClermonTyping: an easy-to-use and accurate in silico method for Escherichia genus strain phylotyping. Microb. Genom. 4:e000192. doi: 10.1099/mgen.0.000192
  • Bok E., Kozanska A., Mazurek-Popczyk J., Wojciech M., Baldy-Chudzik K. (2020). Extended Phylogeny and Extraintestinal Virulence Potential of Commensal Escherichia coli from Piglets and Sows. Int. J. Environ. Res. Public Health 17:366. doi: 10.3390/ijerph17010366
  • CLSI (2019). Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. Secondary Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. Place. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute. doi: 10.3390/ijerph17010366
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