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J-GLOBAL ID：202202263737865229   整理番号：22A0561452

海洋底生珪藻群集の評価:地中海の浅い沿岸水域における組合せ形態学的-メタバーコーディングアプローチからの洞察【JST・京大機械翻訳】

Assessment of marine benthic diatom communities: insights from a combined morphological-metabarcoding approach in Mediterranean shallow coastal waters

著者 (8件)： Perez-Burillo Javier (IRTA-Institute for Food and Agricultural Research and Technology, Marine and Continental Waters Programme, Ctra de Poble Nou Km 5.5, E43540 Sant Carles de la Rapita, Tarragona, Spain) ,  Perez-Burillo Javier (Departament de Geografia, Universitat Rovira i Virgili, C/ Joanot Martorell 15, E43500 Vila-seca, Tarragona, Spain) ,  Valoti Greta (Universita Politecnica delle Marche, Piazza Roma, 22, IT60131 Ancona, Italy) ,  Witkowski Andrzej (Institute of Marine and Environmental Sciences, University of Szczecin, Mickiewicza 16a, 70-383 Szczecin, Poland) ,  Prado Patricia (IRTA-Institute for Food and Agricultural Research and Technology, Marine and Continental Waters Programme, Ctra de Poble Nou Km 5.5, E43540 Sant Carles de la Rapita, Tarragona, Spain) ,  Mann David G. (IRTA-Institute for Food and Agricultural Research and Technology, Marine and Continental Waters Programme, Ctra de Poble Nou Km 5.5, E43540 Sant Carles de la Rapita, Tarragona, Spain) ,  Mann David G. (Royal Botanic Garden Edinburgh, Edinburgh EH3 5LR, Scotland, UK) ,  Trobajo Rosa (IRTA-Institute for Food and Agricultural Research and Technology, Marine and Continental Waters Programme, Ctra de Poble Nou Km 5.5, E43540 Sant Carles de la Rapita, Tarragona, Spain)
資料名： Marine Pollution Bulletin  (Marine Pollution Bulletin)
巻： 174  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0557A  ISSN： 0025-326X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 312bp rbcLマーカーに基づく光学顕微鏡(LM)に基づく同定とDNAメタバーコーディングの長所と短所を検討し,地中海の浅い沿岸環境からの底生珪藻群集を調べた。これに対し,Ebroデルタ湾における異なる亜層から採取した生物膜試料を用いた。1)Ebroデルタ湾は,高多様性珪藻類コミュニティ[LMを同定した249分類群]と2)DNAメタバーコーディングは,DNA参照ライブラリーの不完全性のため,種レベルでこの多様性を効果的に反映する。それにもかかわらず,DNAメタバーコーディングは,シリカ殻を欠いているLMと珪藻類によって見逃される小型で,繊細で希少な珪藻種を検出するための新しい機会を提供する。用いたプライマーは珪藻類のために設計されたが,他のストロメノパイル群のほとんど報告されていないメンバーを成功裏に増幅した。LMとDNAアプローチを組み合わせると,浅い沿岸環境における底生微細藻類コミュニティの生態学的研究に対する強い支持が,それ自身のアプローチよりも,より強力な支持を提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 光学顕微鏡 ,  コミュニティ ,  二酸化ケイ素 ,  DNA【核酸】 ,  *海洋 ,  珪藻類 ,  生態学 ,  *沿岸 ,  生物膜 ,  *水域 ,  プライマー【遺伝】 ,  *モルフォロジー
準シソーラス用語： 微小藻類 ,  分類群 ,  沿岸環境 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 多様性 ,  環境DNA ,  エピバイオティクス ,  微小藻類 ,  スラムノパイル ,  rbcL

分類 (3件)： 海洋汚濁  (SB02040B) ,  バイオアッセイ  (EA03060N) ,  その他の汚染原因物質  (SB05040W)

タイトルに関連する用語 (8件)： 海洋 ,  底生珪藻 ,  群集 ,  評価 ,  地中海 ,  組合せ ,  形態学 ,  洞察