PepSeA:リード最適化を可能にするペプチド配列アラインメントと可視化ツール【JST・京大機械翻訳】

Baylon Javier L.; Ursu Oleg; Muzdalo Anja; Wassermann Anne Mai; Adams Gregory L.; Spale Martin; Mejzlik Petr; Gromek Anna; Pisarenko Viktor; Hancharyk Dzianis; Jenkins Esteban; Bednar David; Chang Charlie; Clarova Kamila; Clarova Kamila; Glick Meir; Bitton Danny A.

文献

J-GLOBAL ID：202202263753869472 整理番号：22A0974226

PepSeA:リード最適化を可能にするペプチド配列アラインメントと可視化ツール【JST・京大機械翻訳】

PepSeA: Peptide Sequence Alignment and Visualization Tools to Enable Lead Optimization

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資料名：
巻： 62 号： 5 ページ： 1259-1267 発行年： 2022年
JST資料番号： A0294A ISSN： 1549-9596 CODEN： JCISD8 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

治療ペプチドは,選択性,親和性,および広範囲の病理に関連する「非薬物性」蛋白質を標的とするそれらの能力に関して,小分子よりも潜在的利点を提供する。それらの重要性にもかかわらず,ペプチドプログラムに関する医薬品化学決定を知らせる現在の分子設計能力は限られている。より具体的には,薬物発見で広く使用されている非天然モチーフを含む線形,環状および架橋ペプチドの構造-活性相関(SAR)解析と可視化の必要がない。このギャップを埋めるために,PepSeA(Peptide Sequence Alignment and Visualization),オープンソース,配列ベースツール(https://github.com/Merck/PepSeA)の自由に利用できるパッケージを開発した。PepSeAは非天然アミノ酸の多重配列アラインメントを可能にし,高分子(HELM)の階層的編集言語による可視化を増強した。ChEMBLペプチドデータセットの段階的SAR分析により,薬剤設定におけるリード最適化キャンペーンにおける意思決定を加速するPepSeAの有用性を示した。PepSeAは,治療ペプチドに対するケモインフォマティクス能力を拡大するための最初の試みであり,迅速でより効率的な設計-試験サイクルを可能にする。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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分子・遺伝情報処理 , 分子構造

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