相互ペプチド-蛋白質相互作用の構造的およびエネルギー的性質への洞察【JST・京大機械翻訳】

Trisciuzzi Daniela; Trisciuzzi Daniela; Siragusa Lydia; Siragusa Lydia; Baroni Massimo; Autiero Ida; Autiero Ida; Nicolotti Orazio; Cruciani Gabriele

文献

J-GLOBAL ID：202202264066945135 整理番号：22A0974212

相互ペプチド-蛋白質相互作用の構造的およびエネルギー的性質への洞察【JST・京大機械翻訳】

Getting Insights into Structural and Energetic Properties of Reciprocal Peptide-Protein Interactions

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資料名：
巻： 62 号： 4 ページ： 1113-1125 発行年： 2022年
JST資料番号： A0294A ISSN： 1549-9596 CODEN： JCISD8 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ペプチド-蛋白質相互作用は,癌や神経変性疾患のような大きく広がった疾患の発症に関与する多くの細胞や代謝過程に重要な役割を担っている。ペプチド-蛋白質界面の構造的特性化の進歩にもかかわらず,それらの相互作用の背後にある分子詳細の詳細な知識は,未だに,まだ困難な仕事である。ここでは,ペプチドと蛋白質の両方の観点に焦点を当て,ペプチド結合部位のin silico形態学的およびエネルギー的研究の最初の包括的研究を示した。PixelDBデータベースから始めて,ペプチド-蛋白質複合体の高品質3D結晶構造の非冗長ベンチマーク収集,各共結晶化ペプチドの性質に基づく最も代表的なカテゴリーの分類分析を実施した。物理化学的および構造的原因相関を明らかにするために,いくつかの解釈可能な幾何学的およびエネルギー記述子を,ペプチドおよび標的蛋白質側の両方から計算した。最後に,結合界面での最も頻度の高いペプチド-蛋白質残基対を調べ,GRID MIFに基づいて広範なエネルギー分析を行い,ペプチド親和性増強相互作用を研究し,合理的薬物設計戦略でさらに利用した。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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分子・遺伝情報処理 , 分子構造

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