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J-GLOBAL ID：202202264126629354   整理番号：22A0749690

胃腺癌の予後を予測するためのフェロトーシス関連長鎖非コードRNAシグネチャの確立と検証【JST・京大機械翻訳】

Establishment and Validation of a Ferroptosis-Related Long Non-Coding RNA Signature for Predicting the Prognosis of Stomach Adenocarcinoma

著者 (8件)： Zhang Shuqiong (1Department of Clinical Laboratory, Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Zheng Naisheng (1Department of Clinical Laboratory, Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Chen Xiaocui (1Department of Clinical Laboratory, Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Du Kun (1Department of Clinical Laboratory, Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Yang Junyao (1Department of Clinical Laboratory, Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Shen Lisong (1Department of Clinical Laboratory, Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Shen Lisong (2Faculty of Medical Laboratory Sciences, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Shen Lisong (3Xin Hua Children’s Hospital, Shanghai, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 818306  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:フェロトーシスは細胞膜損傷に従う調節細胞死の形であり,大部分が鉄仲介酸化に依存する。長い非コードRNA(LncRNA)は,種々の腫瘍の発生と関連する。今日まで,LncRNAはフェロトーシスに介在することが報告されている。したがって,胃腺癌(STAD)における予後フェロトーシス関連lncRNAシグネチャを提供することを意図した。方法:著者らは,FerDbデータベースからフェロトーシス関連遺伝子をダウンロードし,Cancer Genome AtlasからRNA配列決定データと臨床病理学的特徴を調べた。遺伝子微分発現解析を「リムマ」パッケージを用いて行った。Cox回帰分析を用いて,最も低いAIC値を有するフェロトーシス関連lncRNAsシグネチャを決定した。Kaplan-Meier曲線,ROC曲線,およびノモグラムを用いてリスクスコアの予後値を評価した。遺伝子セット濃縮分析(GSEA)を用いて,3つのフェロトーシス関連lncRNAの生物学的機能を調べた。胃癌細胞株と組織におけるLINC01615発現をリアルタイムPCRで測定した。核-細胞質分画アッセイを用いて,LINC01615の細胞内局在を分析した。さらに,LINC01615とその標的フェロトーシス関連mRNAの潜在的標的マイクロRNA(miRNA)を予測するためにバイオインフォマティクスを用いた。【結果】3つのフェロトーシス関連lncRNAシグネチャ(AP000695.2,AL365181.3,およびLINC01615)を同定し,次に,Kaplan-Meier,Cox回帰分析,およびROC曲線は,フェロトーシス関連lncRNAモデルがSTADの予後を予測できることを確認した。GSEAは,3つのフェロトーシス関連lncRNAが細胞外マトリックスと細胞活性に関連するかもしれないことを示した。LINC01615は胃癌細胞株と組織で高度に発現する。核-細胞質分画アッセイは,胃癌細胞株において,ほとんどのLINC01615が細胞質に富んでいることを確認した。バイオインフォマティクスは,さらにLINC01615の4つの潜在的標的miRNAを予測し,26の標的フェロトーシス関連mRNAを描写した。結論:著者らは,STAD患者の予後を予測することができる3フェロトーシス関連lncRNAモデル(AP000695.2,AL365181.3,およびLINC01615)を確立した。また,胃癌および細胞株で高度に発現され,フェロトーシスに関与するceRNAとして作用した,将来における研究に対し,LINC01615の有望な標的を提供することが期待される。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酸化 ,  回帰分析 ,  データベース ,  鉄 ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  細胞質 ,  培養細胞 ,  *予後 ,  胃腫瘍 ,  アンチセンスRNA ,  リアルタイムPCR法
準シソーラス用語： 細胞株 ,  マイクロRNA ,  *非翻訳RNA ,  バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： フェロトーシス ,  長鎖非コードRNA ,  胃腺癌 ,  LINC01615 ,  ノモグラム

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (33件)：

• BartolacciC., AndreaniC., El-GammalY., ScaglioniP. P. (2021). Lipid Metabolism Regulates Oxidative Stress and Ferroptosis in RAS-Driven Cancers: A Perspective on Cancer Progression and Therapy. Front. Mol. Biosci. 8, 706650. doi: 10.3389/fmolb.2021.706650
• ChenX., KangR., KroemerG., TangD. (2021). Broadening Horizons: the Role of Ferroptosis in Cancer. Nat. Rev. Clin. Oncol. 18, 280-296. doi: 10.1038/s41571-020-00462-0
• De Los SantosM. C., DragomirM. P., CalinG. A. (2019). The Role of Exosomal Long Non-coding RNAs in Cancer Drug Resistance. Cancer Drug Resist. 2, 1178-1192. doi: 10.20517/cdr.2019.74
• DengG., LiY., MaS., GaoZ., ZengT., ChenL., et al (2020). Caveolin-1 Dictates Ferroptosis in the Execution of Acute Immune-Mediated Hepatic Damage by Attenuating Nitrogen Stress. Free Radic. Biol. Med. 148, 151-161. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2019.12.026
• DrostenM., BarbacidM. (2020). Targeting the MAPK Pathway in KRAS-Driven Tumors. Cancer cell 37, 543-550. doi: 10.1016/j.ccell.2020.03.013

タイトルに関連する用語 (7件)： 胃腺癌 ,  予後 ,  予測 ,  フェロトーシス ,  長鎖非コードRNA ,  シグネチャ ,  検証