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J-GLOBAL ID：202202264227587502   整理番号：22A1025783

腎細胞癌の血液ベース検出のための有望なバイオマーカーとしての腫瘍誘発血小板【JST・京大機械翻訳】

Tumor-Educated Platelets as a Promising Biomarker for Blood-Based Detection of Renal Cell Carcinoma

著者 (4件)： Xiao Ruotao (1Department of Urology, Peking University Third Hospital, Beijing, China) ,  Liu Cheng (1Department of Urology, Peking University Third Hospital, Beijing, China) ,  Zhang Bo (2Department of Pathology, School of Basic Medical Sciences, Peking University Health Science Center, Beijing, China) ,  Ma Lulin (1Department of Urology, Peking University Third Hospital, Beijing, China)
資料名： Frontiers in Oncology (Web)  (Frontiers in Oncology (Web))
巻： 12  ページ： 844520  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7089A  ISSN： 2234-943X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的:腫瘍誘発血小板(TEP)は多くの癌において有望な液体生検である。しかし,腎細胞癌(RCC)におけるその役割は不明である。このため,この研究はRCC患者におけるTEPの診断値を検討した。方法:血小板を24名のRCC患者と25名の対照から前向きに収集した。RNA-seqは,RCC患者と対照の間の差次的発現遺伝子(DEG)を同定するために実行した。さらに,汎癌TEPのRNA-seqデータをダウンロードし,ランダムに訓練と検証セットに分けた。サポートベクトルマシン(SVM)を用いて訓練セットでパン-癌TEPモデルを開発し,検証セットとRCCデータセットで検証した。最後に,RCCベースのTEPモデルを開発し,SVMアルゴリズムと再帰的特徴除去(RFE)法を通して最適化した。【結果】23のDEG,64(31.5%)の上方制御および139(68.5%)の下方制御が,対照と比べてRCC患者の血小板で検出された。汎発がんTEPモデルは,内部検証(訓練セット,精度98.8%,AUC:0.999;検証セット,精度95.4%,AUC:0.972,異なる腫瘍サブタイプ,精度86.6%~96.1%,AUC:0.952~1.000)で癌を検出する際に高精度であった。しかし,外部検証における汎癌TEPモデルは,RCC患者(精度48.7%,AUC:0.615)において,不十分な診断値を有した。したがって,RCCベースのTEPモデルを開発するために,RFE法を用いてモデルに主に寄与する遺伝子バイオマーカーを選択した。68の遺伝子バイオマーカーを含むRCCベースのTEPモデルは,訓練セットで100%(AUC:1.000),検証セットで88.9%(AUC:0.963),全体コホートで95.9%(AUC:0.988)の診断精度に達した。結論:TEPはRCCの検出において最小侵襲性血液バイオマーカーとして機能する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  最適化 ,  遺伝子 ,  *血小板 ,  *腫瘍 ,  発癌 ,  母集団 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  *腎細胞癌 ,  *バイオマーカー ,  サポートベクトルマシン
準シソーラス用語： 侵襲性 ,  差次的遺伝子発現 ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 腎細胞癌 ,  腫瘍性血小板 ,  バイオマーカー ,  診断 ,  液体生検

分類 (2件)： 泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

引用文献 (36件)：

• Hsieh JJ, Purdue MP, Signoretti S, Swanton C, Albiges L, Schmidinger ML, et al. Renal Cell Carcinoma. Nat Rev Dis Primers (2017) 3:17009. doi: doi: 10.1038/nrdp.2017.9
• Chow WH, Dong LM, Devesa SS. Epidemiology and Risk Factors for Kidney Cancer. Nat Rev Urol (2010) 7:245-57. doi: doi: 10.1038/nrurol.2010.46
• Leibovich BC, Lohse CM, Crispen PL, Boorjian SA, Thompson RH, Blute ML, et al. Histological Subtype is an Independent Predictor of Outcome for Patients With Renal Cell Carcinoma. J Urol (2010) 183:1309-15. doi: doi: 10.1016/j.juro.2009.12.035
• Wiechno P, Kucharz J, Sadowska M, Michalski W, Sikora-Kupis B, Jonska-Gmyrek J, et al. Contemporary Treatment of Metastatic Renal Cell Carcinoma. Med Oncol (2018) 35:156. doi: doi: 10.1007/s12032-018-1217-1
• Méjean A, Ravaud A, Thezenas S, Colas S, Beauval JB, Bensalah K, et al. Sunitinib Alone or After Nephrectomy in Metastatic Renal-Cell Carcinoma. N Engl J Med (2018) 379:417-27. doi: doi: 10.1056/NEJMoa1803675

タイトルに関連する用語 (6件)： 腎細胞癌 ,  血液 ,  バイオマーカー ,  腫瘍 ,  誘発 ,  血小板