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J-GLOBAL ID：202202264308370501   整理番号：22A0947627

タイ,Songkhla湖からのビークド海ヘビ(Hydrophis schistosus)の深部毒分析のための複合プロテオミクス戦略【JST・京大機械翻訳】

Combined proteomic strategies for in-depth venomic analysis of the beaked sea snake (Hydrophis schistosus) from Songkhla Lake, Thailand

著者 (14件)： Choksawangkarn Waeowalee (Department of Biochemistry and Center of Excellence for Innovation in Chemistry, Faculty of Science, Burapha University, Chonburi 20131, Thailand) ,  Sriswasdi Sira (Center of Excellence in Computational Molecular Biology, Faculty of Medicine, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand) ,  Sriswasdi Sira (Research Affairs, Faculty of Medicine, Chulalongkorn University and King Chulalongkorn Memorial Hospital, Bangkok 10330, Thailand) ,  Kalpongnukul Nuttiya (Center of Excellence in Systems Biology, Faculty of Medicine, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand) ,  Kalpongnukul Nuttiya (Interdisciplinary Program of Biomedical Sciences, Graduate School, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand) ,  Wongkongkathep Piriya (Center of Excellence in Systems Biology, Faculty of Medicine, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand) ,  Saethang Thammakorn (Department of Computer Science, Faculty of Science, Kasetsart University, Bangkok 10900, Thailand) ,  Chanhome Lawan (Queen Saovabha Memorial Institute, The Thai Red Cross Society, Bangkok 10330, Thailand) ,  Laoungbua Panithi (Queen Saovabha Memorial Institute, The Thai Red Cross Society, Bangkok 10330, Thailand) ,  Khow Orawan (Queen Saovabha Memorial Institute, The Thai Red Cross Society, Bangkok 10330, Thailand) ,  Sumontha Montri (Ranong Marine Fisheries Research and Development Center, Ranong 85000, Thailand) ,  Chaiyabutr Narongsak (Queen Saovabha Memorial Institute, The Thai Red Cross Society, Bangkok 10330, Thailand) ,  Sitprija Visith (Queen Saovabha Memorial Institute, The Thai Red Cross Society, Bangkok 10330, Thailand) ,  Pisitkun Trairak (Center of Excellence in Systems Biology, Faculty of Medicine, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand)
資料名： Journal of Proteomics  (Journal of Proteomics)
巻： 259  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0073A  ISSN： 1874-3919  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究は,タイ国,Songkhla湖からのビーク海ヘビ(Hydrophis片岩)の毒プロテオームの包括的な特性化に焦点を当てた。H.schistosusは太平洋とインドの海洋で普通に見られる死んだ海ヘビとして考えられる。それらの環境は筋肉麻痺と横紋筋融解を引き起こす。この蛇紋石の有効な処理を開発するためには,詳細な毒液組成を理解する必要がある。本研究では,多重質量分析に基づくアプローチを用いた。ボトムアッププロテオミクスは,トリプシン消化溶液が,ゲル内消化と比較して,同定された多数の毒素蛋白質およびより大きな配列被覆を提供することを明らかにした。さらに,毒腺トランスクリプトーム由来データベースを構築し,このデータベースとUniProtKBを用いて43の既知及び新規毒素蛋白質を同定した。3フィンガー毒素とホスホリパーゼA_2は2つの最も豊富な蛋白質ファミリーであることを示した。マイナー組成は他の毒素ファミリーと多くの非毒素蛋白質を含んでいた。さらに,ハイブリッドde novo配列決定を行い,小蛋白質/ペプチドの同定を強化した。非消化試料を用いて,46の予測毒素ペプチドがあった。この研究からの知見は,蛇紋石の病理学的影響および効果的な抗毒素の将来の発展におけるより良い理解を導くことができた。本研究は,異なる試料調製技術,Serpentes蛋白質データベース検索,トランスクリプトーム由来蛋白質データベース検索,及びハイブリッドde novoペプチド配列決定戦略の組み合わせを用いてタイ湾で発見されたビーキヘビ(H.schistosus)の毒プロテオーム組成のより良い理解を提供した。それは,ホスホリパーゼA_2s(PLA_2s)と3指毒素(3FTxs)の新種を含むビーキヘビ毒中の13の毒素蛋白質ファミリーと新規蛋白質を明らかにした。それはスネーブイト処理の開発および毒素ペプチドからの新規医薬品の発見のための基礎として役立つ。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 質量分析 ,  データベース ,  ペプチド ,  アミノ酸配列 ,  消化 ,  毒素 ,  *海洋 ,  蛇紋石 ,  抗毒素 ,  毒腺 ,  ホスホリパーゼA ,  毒素タンパク質 ,  *プロテオミクス ,  トランスクリプトーム ,  プロテオーム

著者キーワード (5件)： Hydrophis schistosus ,  ビークされた海ヘビ ,  毒 ,  プロテオミクス ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 動物の生化学  (EJ01050P) ,  動物起原の毒性  (GZ03020U)

タイトルに関連する用語 (8件)： タイ ,  湖 ,  海 ,  深部 ,  毒 ,  分析 ,  プロテオミクス ,  戦略