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J-GLOBAL ID：202202264815369929   整理番号：22A1178464

ゲノム解読:植物関連Micromonosporaの遺伝的特徴【JST・京大機械翻訳】

Deciphering Genomes: Genetic Signatures of Plant-Associated Micromonospora

著者 (4件)： Riesco Raul (Department of Microbiology and Genetics, University of Salamanca, Salamanca, Spain) ,  Ortuzar Maite (Department of Microbiology and Genetics, University of Salamanca, Salamanca, Spain) ,  Fernandez-Abalos Jose Manuel (Department of Microbiology and Genetics, University of Salamanca, Salamanca, Spain) ,  Trujillo Martha E. (Department of Microbiology and Genetics, University of Salamanca, Salamanca, Spain)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 13  ページ： 872356  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物のミクロビオームを調節する可能性と植物-微生物相互作用を理解することは,より生産的で持続可能な農業のための新戦略を設計し,自然生態系を維持するのに不可欠である。したがって,重要な疑問は,望ましい宿主表現型をもたらす細菌コンソーシアムを設計する方法である。本研究では,Micromonosporaと既知の宿主植物の間の相互作用に関与する潜在的ゲノム特徴を同定した。多様な環境を代表する74のMicromonosporaゲノムを用いて,微生物-植物関連特徴のスクリーニングと利用可能な植物宿主プロテオームとの比較を組み合わせた新規バイオインフォマティクスパイプラインを用いて,全ての潜在的植物関連遺伝子のデータベースを作成した。菌株を3つのクラスタで回収し,いくつかの環境,植物関連,土壌/根圏,および海洋/マングローブと高度に相関した。それらの単離源に関係なく,ほとんどの菌株は,一般的にスクリーニングされた植物成長促進特性をコードする遺伝子を共有し,一方,植物コロニー形成関連形質における差異が観察された。Arabidopsis thaliana植物を3つの環境から選択した代表的なMicromonospora株を接種した場合,対応する植物表現型において有意差が見られた。著者らの結果は,同定されたゲノムシグネチャが植物に定着する最高の確率を持つこれらの菌株の選択を助け,その幸福に寄与することを示す。これらの結果は,植物成長促進マーカーだけでは,作物生産と生態系の回復を改善する有益な細菌の選択のための良好な指標ではないことを示唆する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *植物 ,  *遺伝 ,  遺伝子 ,  根圏 ,  宿主 ,  表現型 ,  *ゲノム ,  クラスタ ,  *Micromonospora ,  生態系 ,  マングローブ ,  Arabidopsis thaliana ,  持続可能な農業 ,  プロテオーム

著者キーワード (6件)： ゲノム ,  Micromonospora ,  微生物-植物相互作用 ,  内生菌 ,  放線菌 ,  PGP

分類 (1件)： 異種生物間相互作用  (EE01050A)

引用文献 (81件)：

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• Arkin A. P., Cottingham R. W., Henry C. S., Harris N. L., Stevens R. L., Maslov S., et al (2018). KBase: The United States Department of Energy Systems Biology Knowledgebase. Nat. Biotechnol. 36 566-569. doi: 10.1038/nbt.4163
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タイトルに関連する用語 (4件)： ゲノム解読 ,  植物 ,  Micromonospora ,  遺伝