文献

J-GLOBAL ID：202202265000008734   整理番号：22A0161571

定量的DNAメチル化分析を用いた精液からの年齢推定のためのVISAGE強化ツールの開発と研究室間検証【JST・京大機械翻訳】

Development and inter-laboratory validation of the VISAGE enhanced tool for age estimation from semen using quantitative DNA methylation analysis

著者 (25件)： Heidegger A. (Institute of Legal Medicine, Medical University of Innsbruck, Innsbruck, Austria) ,  Pisarek A. (Malopolska Centre of Biotechnology, Jagiellonian University, Krakow, Poland) ,  de la Puente M. (Institute of Legal Medicine, Medical University of Innsbruck, Innsbruck, Austria) ,  de la Puente M. (Forensic Genetics Unit, Institute of Forensic Sciences, University of Santiago de Compostela, Spain) ,  Niederstaetter H. (Institute of Legal Medicine, Medical University of Innsbruck, Innsbruck, Austria) ,  Pospiech E. (Malopolska Centre of Biotechnology, Jagiellonian University, Krakow, Poland) ,  Wozniak A. (Central Forensic Laboratory of the Police, Warsaw, Poland) ,  Schury N. (Federal Criminal Police Office, Wiesbaden, Germany) ,  Unterlaender M. (Federal Criminal Police Office, Wiesbaden, Germany) ,  Sidstedt M. (National Forensic Centre (NFC), Swedish Police Authority, Linkoping, Sweden) ,  Junker K. (National Forensic Centre (NFC), Swedish Police Authority, Linkoping, Sweden) ,  Ventayol Garcia M. (Biological Traces, Netherlands Forensic Institute, Laan van Ypenburg 6, 2497 GB The Hague, The Netherlands) ,  Laurent FX (Institut National de Police Scientifique, Laboratoire de Police Scientifique de Lyon, Ecully Cedex, France) ,  Ulus A. (Institut National de Police Scientifique, Laboratoire de Police Scientifique de Lyon, Ecully Cedex, France) ,  Vannier J. (Institut National de Police Scientifique, Laboratoire de Police Scientifique de Lyon, Ecully Cedex, France) ,  Bastisch I. (Federal Criminal Police Office, Wiesbaden, Germany) ,  Hedman J. (National Forensic Centre (NFC), Swedish Police Authority, Linkoping, Sweden) ,  Hedman J. (Applied Microbiology, Department of Chemistry, Lund University, Lund, Sweden) ,  Sijen T. (Biological Traces, Netherlands Forensic Institute, Laan van Ypenburg 6, 2497 GB The Hague, The Netherlands) ,  Sijen T. (University of Amsterdam, Swammerdam Institute of Life Sciences, Science Park 904, 1098XH Amsterdam, The Netherlands) ,  Branicki W. (Malopolska Centre of Biotechnology, Jagiellonian University, Krakow, Poland) ,  Branicki W. (Central Forensic Laboratory of the Police, Warsaw, Poland) ,  Xavier C. (Institute of Legal Medicine, Medical University of Innsbruck, Innsbruck, Austria) ,  Parson W. (Institute of Legal Medicine, Medical University of Innsbruck, Innsbruck, Austria) ,  Parson W. (Forensic Science Program, The Pennsylvania State University, State College, PA, USA)
資料名： Forensic Science International: Genetics  (Forensic Science International: Genetics)
巻： 56  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3148A  ISSN： 1872-4973  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAメチル化の解析は年代推定のための確立された方法になった。これは,生物学的犯罪場面材料からの年齢推定のための新しい方法を開発するための法医学界において興味を引いている。身体組織からの年齢推定,血液からの大多数について様々なアッセイが利用可能である。精液からの年齢予測は異なるDNAメチル化マーカーを必要とし,法医学分析用に現在開発された唯一のアッセイはSNaPshotまたはピロシークエンシングに基づいている。ここでは,2つのマルチプレックスPCRで標的化した13の候補CpG部位を分析するため,大規模並列配列決定を用いた新しいアッセイを述べた。分析は,協力的運動内のGEノーム(VISAGE)プロジェクトを通して,VISable Attributesの5つのコンソーシアム研究所によって検証され,DNAメチル化レベルおよびDNAメチル化コントロールによる感度の再現可能な定量化のためにテストされた。さらに,2つの精液試料からのWhatman FTAカード上のDNA抽出物と染色を用いて,一致と模倣ケースワークサンプルを評価した。全体として,このアッセイは,13のマーカー位置で高い読取深度(>1000の読み取り)をもたらした。得られたメチル化値は,13のマーカー全体で50%の予想メチル化レベルで2.8%の標準偏差と亜硫酸水素塩変換への50ngのDNA入力で良好な性能を有する堅牢な定量を示した。残りの研究室の一致と精液染色の平均定量に対する1つの参加研究室からの定量の絶対差は,約1%であった。これらの結果は,法医学調査における精液からの年齢推定にロバストで適していることを示した。13マーカーアッセイに加えて,1つのマルチプレックスPCRにおいて5つの年齢マーカーのみを組み合わせたより流線化されたプロトコルを開発した。予備的結果は,2つのアッセイ間のDNAメチル化定量における実質的な違いを示さず,完全な13マーカーツールからのデータで開発された精液に対するVISAGE年齢モデルの適用性を示した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 標準偏差 ,  *メチル化 ,  *DNA【核酸】 ,  *精液 ,  染色 ,  亜硫酸水素塩 ,  法医学 ,  ロバスト性 ,  ターゲティング
準シソーラス用語： 配列解析 ,  *DNAメチル化 ,  CpG ,  DNA抽出 ,  *年齢推定 ,  ピロシークエンス法 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： DNAメチル化 ,  年齢予測 ,  法医学的DNA表現型タイピング ,  重亜硫酸塩配列決定 ,  超並列シークエンシング ,  精液

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  法医学  (GA03000B)

タイトルに関連する用語 (10件)： 定量 ,  DNAメチル化 ,  分析 ,  精液 ,  年齢推定 ,  強化 ,  ツール ,  開発 ,  研究 ,  検証