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J-GLOBAL ID:202202265350766889   整理番号:22A0741072

電子構造に向けた結合原子価法を用いたMo/VFe蛋白質結晶におけるP→πNクラスタの統計的解析【JST・京大機械翻訳】

Statistical analysis of PN clusters in Mo/VFe protein crystals using a bond valence method toward their electronic structures
著者 (3件):
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巻: 12  号:ページ: 5214-5224  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7055A  ISSN: 2046-2069  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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最近,多数のMoFe蛋白質が報告されている,そして,X線結晶学により得られたそれらの結晶データは,蛋白質データバンク(PDB)にアップロードされた。結合原子価法を用いた大きなデータ解析により,著者らは,PDBのすべての沈着した結晶学的データから,53のMoFe蛋白質のすべての119のPクラスタと5つのVFe蛋白質の10のPクラスタにおける79の選択されたPNに基づく結論を作成した。MoFe蛋白質結晶の条件において,静止状態PNクラスタは,2Fe(III)_6Fe(II)の形式的酸化状態を持ち,高い電子非局在化を有する2つの酸化電子正孔を隠すことを提案した。計算は,Fe_1,Fe_2,Fe_5,Fe_6,およびFe_7がFe(2+)として明確に機能し,Fe_3がFe_(III)に著しく起こりやすく,一方,Fe_4とFe_8には種々の程度の混合原子価があることを示した。VFe蛋白質結晶中のPNクラスタでは,Fe1,Fe2,Fe4,Fe5およびFe6はFe2+になる傾向があるが,Fe7およびFe8はFe7およびFe8がより酸化混合原子価であり,Fe3はMoFe蛋白質よりも少し多くの還元混合原子価を示す。MoFe蛋白質のPクラスタにおける空間位置,Fe_3及びFe_6は,FeMo-補因子及び[Fe_4S_4]クラスタ中のホモクエン酸から最短距離を持つ最も酸化され還元された鉄として計算され,従って,潜在的電子輸送サイトとして機能する。本研究は,Mo/VFe蛋白質結晶中のPNクラスターの異なる電子分布を示し,これは,PNクラスタが,Moessbauerと電子常磁性共鳴スペクトルに従って,すべての第一鉄であると結論付けられた,過剰な還元剤を有する溶液からの以前のデータから得られたものから,そのものから,PNクラスターの異なった電子分布を示す。Copyright 2022 Royal Society of Chemistry All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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酵素一般  ,  分子構造 

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