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J-GLOBAL ID：202202266333531501   整理番号：22A0226064

癌細胞株の多重G四重鎖結合リガンド誘導トランスクリプトームマップ【JST・京大機械翻訳】

Multiple G-quadruplex binding ligand induced transcriptomic map of cancer cell lines

著者 (11件)： Revikumar Amjesh (Cancer Research Program, Rajiv Gandhi Centre for Biotechnology, Thiruvananthapuram, India) ,  Kashyap Vivek (Center for Systems Biology and Molecular Medicine, Yenepoya Research Centre, Yenepoya (Deemed To Be University), Mangalore, India) ,  Palollathil Akhina (Center for Systems Biology and Molecular Medicine, Yenepoya Research Centre, Yenepoya (Deemed To Be University), Mangalore, India) ,  Aravind Anjana (Center for Systems Biology and Molecular Medicine, Yenepoya Research Centre, Yenepoya (Deemed To Be University), Mangalore, India) ,  Raguraman Rajeswari (Cancer Research Program, Rajiv Gandhi Centre for Biotechnology, Thiruvananthapuram, India) ,  Raguraman Rajeswari (Health Science Centre, University of Oklahoma, Oklahoma City, USA) ,  Kumar Kenkere Mallikarjunaiah Kiran (Department of Surgical Oncology, Yenepoya Medical College, Yenepoya (Deemed to Be University), Mangalore, India) ,  Vijayakumar Manavalan (Department of Surgical Oncology, Yenepoya Medical College, Yenepoya (Deemed to Be University), Mangalore, India) ,  Prasad Thottethodi Subrahmanya Keshava (Center for Systems Biology and Molecular Medicine, Yenepoya Research Centre, Yenepoya (Deemed To Be University), Mangalore, India) ,  Raju Rajesh (Cancer Research Program, Rajiv Gandhi Centre for Biotechnology, Thiruvananthapuram, India) ,  Raju Rajesh (Center for Systems Biology and Molecular Medicine, Yenepoya Research Centre, Yenepoya (Deemed To Be University), Mangalore, India)
資料名： Journal of Cell Communication and Signaling  (Journal of Cell Communication and Signaling)
巻： 16  号： 1  ページ： 129-135  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4536A  ISSN： 1873-9601  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： G-四重螺旋(G4s)はグアニンに富むDNA配列を有するDNA二次構造のクラスであり,4つの鎖非標準構造に折り畳まれる。ゲノムレベルでは,それらの中心的な役割は,DNA複製,テロメラーゼ機能,トポロジー会合ドメインの構成,および遺伝子発現の調節においてよく確立されている。変化したG4形成および集合により仲介されるゲノム不安定性は,癌および神経変性疾患を含む複数の疾患と関係する。ゲノムにおける潜在的G4領域を予測するための多重ツールも開発し,全ゲノムG4マップも配列決定法により誘導されている。腫瘍形成と関連する遺伝子のシス調節要素におけるG4の濃縮は,このような特異的遺伝子の発現を選択的に結合及び調節できるG4-DNA結合リガンド(G4DBL)の同定に対する要求を加速させた。この状況において,多様な癌細胞株におけるG4DBL応答トランスクリプトームの解析は,新規G4DBLの特異性の評価にとって避けられない。これに対し,異なるG4DBLにより異なって調節される転写物を集合し,これらリガンドの3またはそれ以上の反応で多様な癌細胞系により調節される遺伝子のコアセットを同定した。G4DBLsのトポロジーシフト,折畳み,または破壊に対するG4DBLの作用様式により,このデータセットは,将来,特異的シス調節G4関連遺伝子の発現に基づく複数の癌細胞におけるG4DBLsの比較分析のためのG4DBL応答トランスクリプトームの集合のためのプラットフォームとして役立つと信じている。Copyright The International CCN Society 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 位相幾何学 ,  DNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *腫瘍細胞 ,  ゲノム ,  *多重化 ,  二次構造 ,  DNA複製 ,  遺伝子発現 ,  テロメラーゼ ,  *トランスクリプトーム ,  窒素複素環化合物 ,  ヒドロキシ化合物
準シソーラス用語： *リガンド ,  ドメイン構造 ,  *G-四重鎖 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： phenDC3 ,  TMPyP4 ,  360A ,  APTO-253 ,  AQ1 ,  セントリオールアセンブリ

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： グアニン

タイトルに関連する用語 (7件)： 癌細胞株 ,  多重 ,  G四重鎖 ,  リガンド ,  誘導 ,  トランスクリプトーム ,  マップ