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J-GLOBAL ID：202202266697644836   整理番号：22A0447514

SSRマーカーによって明らかにされたエチオピアオオムギ(Hordeum vulgare L.)在来種の遺伝的多様性,個体群構造及び関係【JST・京大機械翻訳】

Genetic diversity, population structure and relationship of Ethiopian barley (Hordeum vulgare L.) landraces as revealed by SSR markers

著者 (8件)： Dido Allo A. (Ethiopian Biotechnology Institute, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Dido Allo A. (K.L.E.F. Department of Bio-Technology, Green Field, Vaddeswaram, Guntur, India) ,  Krishna M. S. R. (K.L.E.F. Department of Bio-Technology, Green Field, Vaddeswaram, Guntur, India) ,  Assefa Ermias (Ethiopian Biotechnology Institute, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Degefu Dawit T. (Plant Biotechnology Research Program, Ethiopian Institute of Agricultural Research, Melkassa Agricultural Research Centre, Adama, Ethiopia) ,  Singh B. J. K. (K.L.E.F. Department of Bio-Technology, Green Field, Vaddeswaram, Guntur, India) ,  Tesfaye Kassahun (Ethiopian Biotechnology Institute, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Tesfaye Kassahun (Institute of Biotechnology and Department of Microbial Cellular and Molecular Biology, Addis Ababa University, Addis Ababa, Ethiopia)
資料名： Journal of Genetics  (Journal of Genetics)
巻： 101  号： 1  ページ： 9  発行年： 2022年 
JST資料番号： W0537A  ISSN： 0022-1333  CODEN： JOGNAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： in situおよびex situ GenBankの両方で維持されている遺伝資源の評価および特性化は,関連マッピング研究,遺伝的選択,育種および保存活動における将来の利用に重要な意味合いを持つ。本研究の主目的は,49の単純配列反復(SSR)マーカーを用いて,エチオピアの異なるオオムギ成長地域から採取した384のエチオピアオオムギ遺伝子型の遺伝的多様性,個体群構造,および関係を評価することであった。これらの49のSSRマーカーの解析は,遺伝子座あたり平均9.755対立遺伝子を持つ合計478の対立遺伝子を増幅し,その遺伝子座の97.07%が多型であることが観察された。Neiの遺伝的多様性指数(h)は0.654であり,Shannon多様性指数(I)は0.647であり,研究したオオムギ遺伝子型における遺伝的多様性は中程度に高いことを示した。個体群レベルでは,多型遺伝子座(PPL)の平均パーセントは98.37%,h=0.388およびI=0.568であった。遺伝的多様性の最高レベルはArsi個体群で観察された(PPL=100%,h=0.439,I=0.624);観察された最低値は,Jimmaからの個体群であった(PPL=75.51%,h=0.291,I=0.430)。分子変動(AMOVA)分析の結果は,個体群内および集団間で有意な遺伝的分化を示し(P<0.001),個体群内および個体群間でそれぞれ84.21%および15.79%であった。さらに,遺伝的変異分析は,個体群間で0.053の遺伝子分化係数と4.467の遺伝子流動値を示した。384のオオムギ遺伝子型を,STRUCTURE,近隣結合樹および主座標分析に従って7つの遺伝的クラスタに分割し,地理的分布と有意に相関した。これらの結果は,個体群内および個体群間における有意な変動の存在(P<0.001)を示し,個体群内で生じる変動が最も高かった。結果はまた,in situおよびex situ保存による遺伝的保護のような保存戦略の設計を支援するであろう。Copyright Indian Academy of Sciences 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  *オオムギ ,  分化 ,  クラスタ ,  地理的分布 ,  対立遺伝子 ,  *個体群 ,  *在来種 ,  遺伝資源
準シソーラス用語： *個体群構造 ,  *マイクロサテライトマーカー ,  遺伝子流動 ,  主座標分析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 遺伝的多様性 ,  在来種 ,  集団構造 ,  単純配列反復 ,  Hordeum vulgare

分類 (2件)： 麦  (FC03033M) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： SSRマーカー ,  エチオピア ,  オオムギ ,  Hordeum ,  在来種 ,  遺伝的多様性 ,  個体群構造