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J-GLOBAL ID：202202266850843982   整理番号：22A1178661

Colon癌における高温および低温腫瘍と予後を予測するためのRNAメチル化関連lncRNAシグネチャの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of RNA Methylation-Related lncRNAs Signature for Predicting Hot and Cold Tumors and Prognosis in Colon Cancer

著者 (7件)： He Rong (1Cancer Institute, The Affiliated People’s Hospital of Jiangsu University, Zhenjiang, China) ,  Man Changfeng (1Cancer Institute, The Affiliated People’s Hospital of Jiangsu University, Zhenjiang, China) ,  Huang Jiabin (1Cancer Institute, The Affiliated People’s Hospital of Jiangsu University, Zhenjiang, China) ,  He Lian (1Cancer Institute, The Affiliated People’s Hospital of Jiangsu University, Zhenjiang, China) ,  Wang Xiaoyan (2Department of Gastroenterology, The Affiliated Suqian First People’s Hospital of Nanjing Medical University, Suqian, China) ,  Lang Yakun (1Cancer Institute, The Affiliated People’s Hospital of Jiangsu University, Zhenjiang, China) ,  Fan Yu (1Cancer Institute, The Affiliated People’s Hospital of Jiangsu University, Zhenjiang, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 870945  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： N6-メチルアデノシン(m6A),N1-メチルアデノシン(m1A),5-メチルシトシン(m5C),および7-メチルグアノシン(m7G)はRNAメチル化修飾の主要な形態であり,多くの腫瘍の発生と密接に関連する。しかし,結腸癌(CC)におけるRNAメチル化関連長非コードRNA(lncRNA)の予後値は明らかにされていない。本研究は,50m6A/m1A/m5C/m7G関連遺伝子を総括し,RNA-seqデータおよび癌ゲノムアトラス(TCGA)データベースからの臨床病理学的情報を有する41の正常および471のCC腫瘍試料をダウンロードした。合計1057のRNAメチル化関連lncRNA(RMlncRNA)をピアソン相関分析により同定した。予後値を有する23のRMlncRNAを単変量Cox回帰分析を用いてスクリーニングした。コンセンサスクラスタ分析により,CC患者を異なる臨床転帰と免疫微小環境浸潤特性を有する2つの分子サブタイプ(Cluster1とクラスタ2)に分類した。クラスター2は,より良い予後を有する「ホット腫瘍」と考えられ,一方,クラスター1は,より悪い予後で「冷たい腫瘍」と見なされた。続いて,最小絶対収縮と選択オペレータ(LASSO)Cox回帰を用いて7lncRNA予後シグネチャを構築した。他の臨床形質との組み合わせで,RNAメチル化関連lncRNA予後シグネチャ(”RMlncスコア”)が結腸癌患者の独立予後因子であることを見いだした。さらに,免疫浸潤,免疫療法応答分析,および半最大阻害濃度(IC50)は,低RMlncスコア群が免疫療法により感受性が高く,一方,高RMlncスコア群は,より多くの化学療法剤に感受性であることを示した。要約すると,開発したRMlncスコアを用いて,CC患者の予後,免疫療法応答,および薬物感受性を予測し,より正確で,個別化した治療レジメンをガイドした。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *高温 ,  *低温 ,  回帰分析 ,  データベース ,  浸潤 ,  遺伝子 ,  *腫瘍 ,  クラスタ ,  クラスタ分析 ,  免疫療法 ,  *予後 ,  結腸腫瘍 ,  薬剤感受性
準シソーラス用語： 予後因子 ,  微小環境 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 結腸癌 ,  RNAメチル化 ,  長鎖非コードRNA ,  免疫療法 ,  腫瘍免疫微小環境

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (71件)：

• AnY., DuanH. (2022). The Role of m6A RNA Methylation in Cancer Metabolism. Mol. Cancer 21 (1), 14. doi: 10.1186/s12943-022-01500-4
• CaoS.-Q., ZhengH., SunB.-C., WangZ.-L., LiuT., GuoD.-H., et al (2019). Long Non-Coding RNA Highly Up-Regulated in Liver Cancer Promotes Exosome Secretion. World J. Gastroenterol. 25 (35), 5283-5299. doi: 10.3748/wjg.v25.i35.5283
• ChaiX.-K., QiW., ZouC.-Y., HeC.-X., SuM., ZhaoD.-Q. (2021). Potential Prognostic Value of a Seven m6A-Related LncRNAs Signature and the Correlative Immune Infiltration in Colon Adenocarcinoma. Front. Genet. 12, 774010. doi: 10.3389/fgene.2021.774010
• ChanT. A., YarchoanM., JaffeeE., SwantonC., QuezadaS. A., StenzingerA., et al (2019). Development of Tumor Mutation burden as an Immunotherapy Biomarker: Utility for the Oncology Clinic. Ann. Oncol. 30 (1), 44-56. doi: 10.1093/annonc/mdy495
• ChenK., SongB., TangY., WeiZ., XuQ., SuJ., et al (2021). RMDisease: A Database of Genetic Variants that Affect RNA Modifications, with Implications for Epitranscriptome Pathogenesis. Nucleic Acids Res. 49 (D1), D1396-d1404. doi: 10.1093/nar/gkaa790

タイトルに関連する用語 (9件)： 癌 ,  低温 ,  腫瘍 ,  予後 ,  予測 ,  RNAメチル化 ,  lncRNA ,  シグネチャ ,  同定