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J-GLOBAL ID：202202267133147911   整理番号：22A0456058

遺伝子族進化は硬骨魚類の視床下部における細胞型多様化の基礎をなす【JST・京大機械翻訳】

Gene family evolution underlies cell-type diversification in the hypothalamus of teleosts

著者 (10件)： Shafer Maxwell E. R. (Biozentrum, University of Basel, Basel, Switzerland) ,  Shafer Maxwell E. R. (Department of Molecular and Cellular Biology, Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Sawh Ahilya N. (Biozentrum, University of Basel, Basel, Switzerland) ,  Sawh Ahilya N. (Department of Molecular and Cellular Biology, Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Schier Alexander F. (Biozentrum, University of Basel, Basel, Switzerland) ,  Schier Alexander F. (Department of Molecular and Cellular Biology, Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Schier Alexander F. (Allen Discovery Center for Cell Lineage Tracing, Seattle, WA, USA) ,  Schier Alexander F. (Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA) ,  Schier Alexander F. (Harvard Stem Cell Institute, Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Schier Alexander F. (Center for Brain Science, Harvard University, Cambridge, MA, USA)
資料名： Nature Ecology & Evolution  (Nature Ecology & Evolution)
巻： 6  号： 1  ページ： 63-76  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4775A  ISSN： 2397-334X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細胞型の束は脊椎動物の脳を形成するが,類似した細胞レパートリーが種内または種内にあるか,または細胞型多様性がどのように進化するかはほとんど知られていない。種内および種内の細胞型多様性を調べるために,ゼブラフィッシュ(Danio rerio)およびメキシコテトラ(Astyanax mexicanus)の表面および洞窟形態から,ΔΨ130,000視床下部細胞の単一細胞RNA配列決定を行った。75%以上の細胞型がゼブラフィッシュとメキシコのテトラの間で共有され,150百万年前に共通の祖先から分岐したことを見出した。共有細胞タイプは,ゲノム重複後のサブ機能化により生成されたパラログ発現におけるシフトを示した。神経ペプチドのような末端エフェクター遺伝子の発現は,それらの関連転写調節因子の発現より保存されていた。種特異的細胞型は種特異的遺伝子の発現に富んでおり,最近拡大したまたは収縮した遺伝子ファミリーのメンバーの発現パターンの新機能化によって特徴付けられた。表面および洞窟形態間の比較は,ゲノム差と関連した神経ペプチド作動性細胞型における免疫レパートリーおよび転写変化の違いを明らかにした。ここで示した単一細胞アトラスは,視床下部細胞型を探索する強力な資源であり,遺伝子ファミリーの進化とパラログ発現におけるシフトが細胞多様性にどのように寄与するかを明らかにする。メキシコテトラのゼブラフィッシュおよび表面および洞窟形態からの視床下部細胞の単細胞トランスクリプトミクスは,細胞型の保存を示し,細胞新規性は,遺伝的新規性およびパラログ遺伝子の種特異的発現と関係する。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature Limited 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  *視床下部 ,  洞窟 ,  ゲノム ,  神経ペプチド ,  ゼブラフィッシュ ,  遺伝子重複
準シソーラス用語： トランスクリプトーム解析 ,  単一細胞 ,  転写調節因子 ,  パラロガス遺伝子 ,  遺伝子ファミリー ,  *細胞型 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 遺伝子 ,  進化 ,  硬骨魚類 ,  視床下部 ,  細胞型 ,  多様化 ,  基礎