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J-GLOBAL ID：202202267465310491   整理番号：22A0440598

メチルTROSY応用のための自動化メチル割当に向けての進歩【JST・京大機械翻訳】

Progress toward automated methyl assignments for methyl-TROSY applications

著者 (5件)： Clay Mary C. (Department of Structural Biology, St Jude Children’s Research Hospital, Memphis, TN, USA) ,  Saleh Tamjeed (Department of Structural Biology, St Jude Children’s Research Hospital, Memphis, TN, USA) ,  Kamatham Samuel (Department of Structural Biology, St Jude Children’s Research Hospital, Memphis, TN, USA) ,  Rossi Paolo (Department of Structural Biology, St Jude Children’s Research Hospital, Memphis, TN, USA) ,  Kalodimos Charalampos G. (Department of Structural Biology, St Jude Children’s Research Hospital, Memphis, TN, USA)
資料名： Structure  (Structure)
巻： 30  号： 1  ページ： 69-79.e2  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1212A  ISSN： 0969-2126  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： メチル-TROSY分光法は,溶液状態NMRの到達を,サイズ100kDa以上の超分子機械に拡大した。メチル基は,原子分解能を有する準生理的条件における構造,動力学および蛋白質-蛋白質相互作用を研究するための理想的なプローブである。方法論の成功した実装は,正確なメチル化学シフト帰属を必要とし,タスクは,まだ分野において大きな課題を提起する。本研究では,メチルラベリング,データ収集,データ解析,および核Overhauser効果(NOE)ベースの自動化メチル割当てアプローチのための技術の現状を概説した。MAGIC-ActとMAGIC-View,2つのPython拡張を,ポピュラーなNMRFAM-Sparkyパッケージの一部として開発した2つのPython拡張,およびMAGIC-Netは独立構造ベースネットワーク解析プログラムを提示した。MAGIC-Actは,3D HMBC-HMQCにより誘導したLeu/Valペアリング,およびNOESY交差ピーク対称性検査を統計的に駆動したアミノ酸タイピングを行う。MAGIC-NetはモデルベースのNOE統計を提供し,メチルラベリングスキームの選択を助ける。このプログラムは,迅速なメチル帰属のための多目的で半自動化されたフレームワークを提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： NMR【磁気共鳴】 ,  対称性 ,  *自動化 ,  メチル化 ,  アミノ酸 ,  タンパク質 ,  三次元 ,  データ収集 ,  NOESY
準シソーラス用語： 蛋白質間相互作用 ,  分子機械 ,  *TROSY ,  半自動化 ,  Python ,  メチル基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： NMR ,  高重水素化大型蛋白質 ,  メチルトロー ,  メチル割当 ,  MAGICアルゴリズム

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： TROSY ,  応用 ,  自動化 ,  割当