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J-GLOBAL ID：202202267587636212   整理番号：22A0442772

移植アカゲザルにおける造血幹および前駆細胞オフターゲット編集の予測および検証【JST・京大機械翻訳】

Prediction and validation of hematopoietic stem and progenitor cell off-target editing in transplanted rhesus macaques

著者 (30件)： AlJanahi Aisha A. (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  AlJanahi Aisha A. (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Georgetown University, Washington, DC 20057, USA) ,  Lazzarotto Cicera R. (Department of Hematology, St. Jude Children’s Research Hospital, Memphis, TN 38105, USA) ,  Chen Shirley (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Shin Tae-Hoon (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Cordes Stefan (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Fan Xing (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Jabara Isabel (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Zhou Yifan (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Young David J. (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Lee Byung-Chul (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Yu Kyung-Rok (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Yu Kyung-Rok (Department of Agricultural Biotechnology and Research Institute of Agriculture and Life Sciences, Seoul National University, Seoul 08826, Republic of Korea) ,  Li Yuesheng (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Toms Bradley (Thermo Fisher, Frederick, MD 21704, USA) ,  Tunc Ilker (Bioinformatics and Computational Biology Laboratory, NHLBI, NIH, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Hong So Gun (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Truitt Lauren L. (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Klermund Julia (Institute for Transfusion Medicine and Gene Therapy, Medical Center - University of Freiburg, 79106 Freiburg, Germany) ,  Klermund Julia (Faculty of Medicine, University of Freiburg, 79110 Freiburg, Germany) ,  Andrieux Geoffroy (Faculty of Medicine, University of Freiburg, 79110 Freiburg, Germany) ,  Andrieux Geoffroy (Institute of Medical Bioinformatics and Systems Medicine, Medical Center-University of Freiburg, Faculty of Medicine, University of Freiburg, 79110 Freiburg, Germany) ,  Andrieux Geoffroy (German Cancer Consortium (DKTK) and German Cancer Research Center (DKFZ), Partner Site Freiburg, 79106 Freiburg, Germany) ,  Kim Miriam Y. (Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA 19104, USA) ,  Kim Miriam Y. (Department of Medicine, Division of Oncology, Washington University School of Medicine, Saint Louis, MO 63110, USA) ,  Cathomen Toni (Institute for Transfusion Medicine and Gene Therapy, Medical Center - University of Freiburg, 79106 Freiburg, Germany) ,  Cathomen Toni (Faculty of Medicine, University of Freiburg, 79110 Freiburg, Germany) ,  Gill Saar (Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA 19104, USA) ,  Tsai Shengdar Q. (Department of Hematology, St. Jude Children’s Research Hospital, Memphis, TN 38105, USA) ,  Dunbar Cynthia E. (Translational Stem Cell Biology Branch, NHLBI, NIH, Building 10-CRC, 5E-3332, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892, USA)
資料名： Molecular Therapy  (Molecular Therapy)
巻： 30  号： 1  ページ： 209-222  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1762A  ISSN： 1525-0016  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： プログラマブルヌクレアーゼ技術CRISPR-Cas9は,過去10年で遺伝子編集を革命した。オフターゲット編集のリスクにより,オフターゲット特性化のための正確で高感度な方法は,CRISPR-Cas9を治療的に適用する前に重要である。ここでは,ゲノム配列比較のみに基づくin silico予測(ISP)とin vitroオフターゲット予測法CIRCLE-seqの予測値を比較するためにアカゲザルモデルを利用した。ISPとCIRCLE-seqにより予測される数千のオフターゲット部位を有するCD33ガイドRNA(gRNA)に対するCIRCLE-seqとISPにより予測されるオフターゲット部位を検証するためにAmpliSeq HD誤差補正配列決定を用いた。2つの方法で予測されたサイト間に弱い相関を見出した。各方法で予測したほぼ500の部位を移植後の造血細胞の誤差補正配列決定により分析し,19のオフターゲット部位が挿入または欠失変異を明らかにした。これらのサイトのうち,8つは,両方の方法,CIRCLE-seqだけによる8,およびISPだけによる3によって予測された。これらのオフターゲットエディットを持つ細胞のレベルは,動物においてin vivoで膨張または異常行動を示さなかった。さらに,移植後の動物に存在する標的部位とオフターゲット部位間の転座を探索するためにCAST-seqと呼ばれる不偏法を使用し,移植後少なくとも1年間,血液細胞に持続した1つの特異的転座を検出した。結論として,CIRCLE-seqまたはISPは,全ての部位を予測しず,注意深いgRNAデザインの組み合わせと,複数の方法による標的細胞での予想外標的部位のスクリーニングが,臨床開発の安全性の最適化に必要である。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化 ,  血球 ,  誤り訂正 ,  *造血 ,  *アカゲザル ,  キャラクタリゼーション ,  高感度 ,  転座 ,  欠失突然変異 ,  in vitro実験
準シソーラス用語： in silico ,  *前駆細胞 ,  造血細胞 ,  ゲノム配列 ,  CD33抗原 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： CRISC ,  Ca9 ,  遺伝子編集 ,  オフターゲット ,  遺伝子治療 ,  マカク ,  転座 ,  誤り訂正シーケンシング

分類 (1件)： 遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (8件)： 移植 ,  アカゲザル ,  造血 ,  幹 ,  前駆細胞 ,  オフターゲット編集 ,  予測 ,  検証