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J-GLOBAL ID：202202268707399615   整理番号：22A0228860

マルチオミクスネットワークによる乳頭甲状腺癌の予後と治療に対するシステムバイオマーカー【JST・京大機械翻訳】

Systems biomarkers for papillary thyroid cancer prognosis and treatment through multi-omics networks

著者 (8件)： Gulfidan Gizem (Department of Bioengineering, Faculty of Engineering, Marmara University, Istanbul, Turkey) ,  Soylu Melisa (Department of Bioengineering, Faculty of Engineering, Marmara University, Istanbul, Turkey) ,  Demirel Damla (Department of Bioengineering, Faculty of Engineering, Marmara University, Istanbul, Turkey) ,  Erdonmez Habib Burak Can (Department of Bioengineering, Faculty of Engineering, Marmara University, Istanbul, Turkey) ,  Beklen Hande (Department of Bioengineering, Faculty of Engineering, Marmara University, Istanbul, Turkey) ,  Ozbek Sarica Pemra (Department of Bioengineering, Faculty of Engineering, Marmara University, Istanbul, Turkey) ,  Arga Kazim Yalcin (Department of Bioengineering, Faculty of Engineering, Marmara University, Istanbul, Turkey) ,  Turanli Beste (Department of Bioengineering, Faculty of Engineering, Marmara University, Istanbul, Turkey)
資料名： Archives of Biochemistry and Biophysics  (Archives of Biochemistry and Biophysics)
巻： 715  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： B0023A  ISSN： 0003-9861  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 乳頭状甲状腺癌(PTC)に関連する生体分子の同定は,疾患メカニズムの解明および有効な診断および治療戦略の開発にとって最も重要である。この点に関する特別な知見にもかかわらず,異なる生物学的レベルからの分子データを含む全体論的解析は不足している。本研究では,4つのトランスクリプトームデータセットのメタ分析を行い,PTCにおける遺伝子発現シグネチャを同定し,レポーター分子を3つの主要な細胞ネットワーク,すなわち転写調節,蛋白質-蛋白質相互作用,および代謝ネットワークに遺伝子発現データをマッピングすることによって測定した。すべてのPTCデータセットで差次的に発現する282の共通遺伝子を同定した。さらに,6つの蛋白質(FYN,JUN,LYN,PML,SIN3A,およびRARA),2つのErb-B2受容体(ERBB2とERBB4),2つのサイクリン依存性受容体(CDK1とCDK2),および3つのヒストンデアセチラーゼ受容体(HDAC1,HDAC2,およびHDAC3)は,メタボロームレベルでラクトアルデヒドとプロリンを含むいくつかの代謝産物に加えて,プロテオミクスシグネチャとして突出した。12のTFと110のmiRNAのカルシウムとMAPKシグナル伝達経路と転写および転写後活性の有意な関連も,調節レベルで観察された。それらの間で,6つのmiRNA(miR-30b-3p,miR-15b-5p,let-7a-5p,miR-130b-3p,miR-424-5p,miR-193b-3p)は,文献において初めてPTCと関連し,miR-30b-3p,miR-15b-5p,およびlet-7a-5pの発現レベルは,疾患予後の予測であった。薬剤再配置および分子ドッキングシミュレーションは,5種類の薬剤(プロクロルペラジン,メクリジン,ロトレリン,セファエリンおよびトレチノイン)がPTCの治療に有用であることを明らかにした。したがって,著者らは,PTCのためのさらなる実験的および臨床試験のための予後バイオマーカーまたは潜在的治療標的として考えられる生体分子候補を報告する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  カルシウム ,  遺伝子 ,  受容体 ,  *予後 ,  遺伝子発現 ,  *甲状腺腫瘍 ,  サイクリン ,  *バイオマーカー ,  プロテオミクス ,  ヒストンデアセチラーゼ ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  メタボローム ,  転写調節 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 甲状腺乳頭癌 ,  甲状腺癌 ,  バイオマーカー ,  規制ネットワーク ,  蛋白質-蛋白質相互作用ネットワーク ,  代謝ネットワーク

分類 (3件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  抗腫よう薬の基礎研究  (GW16010A)

タイトルに関連する用語 (6件)： マルチオミクス ,  乳頭 ,  甲状腺癌 ,  予後 ,  治療 ,  バイオマーカー