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J-GLOBAL ID：202202268866174978   整理番号：22A1024447

トランスクリプトーム解析はCucurbita pepo L.における種子被覆発生の分子機構を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic Analysis Reveal the Molecular Mechanisms of Seed Coat Development in Cucurbita pepo L.

著者 (10件)： Xue Yingyu (College of Plant Protection, Gansu Agricultural University, Lanzhou, China) ,  Xue Yingyu (Biocontrol Engineering Laboratory of Crop Diseases and Pests of Gansu Province, College of Plant Protection, Gansu Agricultural University, Lanzhou, China) ,  Shen Zhiyan (College of Plant Protection, Gansu Agricultural University, Lanzhou, China) ,  Shen Zhiyan (Biocontrol Engineering Laboratory of Crop Diseases and Pests of Gansu Province, College of Plant Protection, Gansu Agricultural University, Lanzhou, China) ,  Tao Fei (College of Plant Protection, Gansu Agricultural University, Lanzhou, China) ,  Tao Fei (Biocontrol Engineering Laboratory of Crop Diseases and Pests of Gansu Province, College of Plant Protection, Gansu Agricultural University, Lanzhou, China) ,  Zhou Jingjiang (Biocontrol Engineering Laboratory of Crop Diseases and Pests of Gansu Province, College of Plant Protection, Gansu Agricultural University, Lanzhou, China) ,  Zhou Jingjiang (State Key Laboratory Breeding Base of Green Pesticide and Agricultural Bioengineering, Ministry of Education, Guizhou University, Guiyang, China) ,  Xu Bingliang (College of Plant Protection, Gansu Agricultural University, Lanzhou, China) ,  Xu Bingliang (Biocontrol Engineering Laboratory of Crop Diseases and Pests of Gansu Province, College of Plant Protection, Gansu Agricultural University, Lanzhou, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 13  ページ： 772685  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Cucurbita pepoは,最も初期の栽培作物の1つである。それは,中央と南アメリカに固有であり,現在,その豊富な栄養,短い成長期間,および高収量のために世界中で広く栽培され,間作に適している。Hull-less C.pepo L.(HLCP)は,消費が容易である自然界のまれな変異体である。その種子は種子核を持つが,種皮を欠いている。HLCP品種における種皮発生の欠如の根底にある分子機構はまだ明らかではない。BGISEQ-500配列決定プラットフォームを用いて,受粉後3段階(8,18,および28日)で,殻付きC.pepo(CP)およびHLCPから種皮の18のcDNAライブラリーを配列させた。HLCP品種の種皮におけるリグニン蓄積はCP品種のそれよりはるかに低いことを見出した。合計2,099のDEGをCP品種で同定し,それは主にフェニルプロパノイド生合成経路,アミノ糖,およびヌクレオチド糖代謝経路に富んでいた。合計1831のDEGがHLCP品種で同定され,主にフェニルプロパノイド生合成と澱粉とショ糖の代謝経路に富んでいた。DEGの中で,ハブ蛋白質(FusA),蛋白質キナーゼ(IRAK4),および種皮発生に関連するいくつかの転写因子(MYB,bHLH,NAC,AP2/EREBP,WRKY)がCP品種でアップレギュレートされた。12のランダムに選択したDEGの相対的発現レベルを,定量的リアルタイムPCR分析を用いて測定し,0.9474の相関係数で,RNA-Seqを用いて得たそれらと一致することを見出した。IRAK4蛋白質キナーゼ,AP2/EREBP,MYB,bHLH,およびNAC転写因子が種皮発生において重要な役割を果たし,HLCPの形成をもたらすことを見出した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： リグニン ,  *解析 ,  農作物 ,  生合成 ,  アミノ糖 ,  RNA【核酸】 ,  タンパク質 ,  澱粉 ,  栽培 ,  代謝経路 ,  受粉 ,  品種 ,  *遺伝学実験技術 ,  転写因子 ,  *カボチャ属 ,  二糖類 ,  ピラノシド ,  フラノシド ,  グルコシド ,  フルクトオリゴ糖
準シソーラス用語： *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 種皮の開発 ,  転写プロファイリング ,  転写因子 ,  リグニン生合成 ,  包まれたCucurbita pepo ,  無殻Cucurbita pepo L.

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (1件)： 蔗糖

引用文献 (75件)：

• Abid G., Silue S., Muhovski Y., Jacquemin J. M., Toussaint A., Baudoin J. P. (2009). Role of myo-inositol phosphate synthase and sucrose synthase genes in plant seed development. Gene 439 1-10. doi: 10.1016/j.gene.2009.03.007
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• Ashburner M., Ball C. A., Blake J. A., Botstein D., Butler H., Cherry J. M., et al (2000). Gene ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium. Nat. Genet. 25 25-29. doi: 10.1038/75556
• Bahadori M. H., Azari Z., Zaminy A., Dabirian S., Mehrdad S. M., Kondori B. J. (2021). Anti-proliferative and apoptotic effects of hull-less pumpkin extract on human papillary thyroid carcinoma cell line. Anat. Cell Biol. 54 104-114. doi: 10.5115/acb.20.228

タイトルに関連する用語 (4件)： トランスクリプトーム解析 ,  Cucurbita ,  種子被覆 ,  分子