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J-GLOBAL ID：202202269500650152   整理番号：22A0686500

Pipidae水生カエルにおけるLINE要素のゲノム調査はこれらのゲノムにおけるRex要素進化に光を当てる【JST・京大機械翻訳】

A genomic survey of LINE elements in Pipidae aquatic frogs shed light on Rex-elements evolution in these genomes

著者 (9件)： Moura Gama Joana (Programa de Pos-Graduacao em Genetica (PPG-GEN), Universidade Federal do Parana (UFPR), Curitiba, Brazil) ,  Moura Gama Joana (Laboratorio de Citogenetica evolutiva e Conservacao Animal (LabCeca), Departamento de Genetica, Universidade Federal do Parana (UFPR), Brazil) ,  Ludwig Adriana (Laboratorio de Ciencias e Tecnologias Aplicadas em Saude (LaCTAS), Instituto Carlos Chagas, Fiocruz-PR, Brazil) ,  Gazolla Camilla Borges (Programa de Pos-Graduacao em Genetica (PPG-GEN), Universidade Federal do Parana (UFPR), Curitiba, Brazil) ,  Gazolla Camilla Borges (Laboratorio de Citogenetica evolutiva e Conservacao Animal (LabCeca), Departamento de Genetica, Universidade Federal do Parana (UFPR), Brazil) ,  Guizelini Dieval (Programa de Pos-Graduacao em Bioinformatica, Universidade Federal do Parana, Curitiba, Brazil) ,  Recco-Pimentel Shirlei Maria (Departamento de Biologia Estrutural e Funcional, Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Brazil) ,  Bruschi Daniel Pacheco (Programa de Pos-Graduacao em Genetica (PPG-GEN), Universidade Federal do Parana (UFPR), Curitiba, Brazil) ,  Bruschi Daniel Pacheco (Laboratorio de Citogenetica evolutiva e Conservacao Animal (LabCeca), Departamento de Genetica, Universidade Federal do Parana (UFPR), Brazil)
資料名： Molecular Phylogenetics and Evolution  (Molecular Phylogenetics and Evolution)
巻： 168  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1678A  ISSN： 1055-7903  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転移可能な要素(TE)は,遺伝的多様化の構成要素として作用する大きな部分を占める。レトロトランスポゾンのLINE順序は,最も代表的で多様なTEsであり,無尾類ではほとんど研究されていない。ここでは,Pipidae種におけるRexと称される要素,特にアフリカツメガエルのゲノムにおいて,オーロン,同種四倍体姉妹種Xenopus laevis,およびアメリカ種Pipa carvalhoiの研究におけるモデルゲノムとして,より具体的には,その要素に重点をおいて,LINE多様性を調査したものである。”Pipidae tropicalis”のゲノムにおいて,より具体的には,Xenopus tropicalisのゲノムにおいて,より特異的であった。これらの3つの種において5つのクレード,Rex1,L2,CR1,L1およびTx1からLINEの大きな多様性を同定でき,RTEクレードはX.tropicalisで失われた。Rexとして分類された元素は,異なるクレードに分布することが明らかになった。Rex1エレメントの進化パターンは,系統発生的不一致だけでなくTE配列で見出された非常に低いK_s値によっても支持された,魚類と両生類の間のファミリーといくつかの水平移動事象の独立した損失を伴う複雑な進化を示す。ここで得られたデータは,X.laevisにおけるLINEの多様性の知識を更新し,P.carvalhoiにおけるTEの最初の研究を示す。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝 ,  両生類 ,  系統発生 ,  *ゲノム ,  *ピパ科 ,  アフリカツメガエル ,  四倍体 ,  多様化 ,  レトロトランスポゾン ,  水平変位
準シソーラス用語： Xenopus tropicalis ,  *LINE ,  クレード , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 転位可能な要素 ,  ライン ,  水平移動 ,  安浦

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

物質索引 (1件)： オーロン

タイトルに関連する用語 (7件)： Pipidae ,  カエル ,  LINE ,  要素 ,  ゲノム ,  調査 ,  進化