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J-GLOBAL ID：202202269505178655   整理番号：22A1176727

胎児期および思春期前のヤギ第一胃における環状RNAのトランスクリプトームプロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic Profiling of Circular RNAs in the Goat Rumen During Fetal and Prepubertal Period

著者 (12件)： Zhong Tao (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Wang Cheng (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Wang Meng (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Zhan Siyuan (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Freitas-de-Melo Aline (Departamento de Biociencias Veterinarias, Facultad de Veterinaria, Universidad de la Republica, Montevideo, Uruguay) ,  Wang Linjie (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Cao Jiaxue (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Dai Dinghui (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Guo Jiazhong (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Li Li (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Zhang Hongping (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Niu Lili (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China)
資料名： Frontiers in Physiology (Web)  (Frontiers in Physiology (Web))
巻： 13  ページ： 858991  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7093A  ISSN： 1664-042X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 円形RNA(circRNA)は,種々の生物活性において不可欠な機能を有する重要な調節因子である。しかし,ヤギにおける第一胃発生中のcircRNAの遺伝的調節に関してはほとんど報告されていない。本研究の目的は,胎児発育中および離乳前後におけるヤギの第一胃におけるcirRNAのゲノムワイド発現プロファイルを同定することであった。組織学的形態は,胎児期(妊娠の60日および135日)から思春期前期間(年齢60および150日)まで,第一胃乳頭が徐々に発達し,ルーメン筋層の厚みが増加したことを示した。全部で11,149circRNAをRNA配列決定により4つの発達段階で同定した。これから,1,518は特異的に発現したcircRNA(DEC)であった。58のDECは,妊娠の60から135日と妊娠の135日から生後30日までの93日まで上方制御された。DECの大きな割合(598)は,妊娠の135日から生後30日までダウンレギュレートされた。6つのランダムに選択した循環RNAの発現レベルをqPCRによって確認し,それらのバックスプライシング接合(BSJ)部位も確認した。オントロジーと経路分析は,DECの親遺伝子が細胞増殖とアポトーシスに関連するシグナル伝達経路に主に関与することを明らかにした。それらの標的miRNAsとサーコRNAの相互作用ネットワークは,細胞増殖とアポトーシスシグナル伝達経路への関与を示した。結論として,著者らは,胎児発育の間および離乳の前後におけるヤギの第一胃における循環RNAの全ゲノム発現プロファイルを同定した。これらの結果は,第一胃組織の発達に対する循環RNAの調節効果に関するさらなる研究の基礎を提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  胎児 ,  妊娠 ,  *ヤギ ,  細胞増殖 ,  離乳 ,  *思春期 ,  アポトーシス ,  オントロジー ,  *トランスクリプトーム ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： *胎生期 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Capra hircus ,  胎児 ,  子供たち ,  第一胃 ,  サーカムRNA ,  差次的発現

分類 (2件)： 牛  (FD02020Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (46件)：

• Arcinas C., Tan W., Fang W., Desai T., Teh D., Degirmenci U., et al (2019). Adipose circular RNAs exhibit dynamic regulation in obesity and functional role in adipogenesis. Nat. Metab. 1 688-703. doi: 10.1038/s42255-019-0078-z
• Chang T. H., Huang H. Y., Hsu J. B. K., Weng S. L., Horng J. T., Huang H. D. (2013). An enhanced computational platform for investigating the roles of regulatory RNA and for identifying functional RNA motifs. BMC Bioinformatics 14:S4. doi: 10.1186/1471-2105-14-S2-S4
• Chen Y. G., Satpathy A. T., Chang H. Y. (2017). Gene regulation in the immune system by long noncoding RNAs. Nat. Immunol. 18 962-972. doi: 10.1186/1471-2105-14-S2-S4
• China National Commission of Animal Genetic Resources (2011). Animal Genetic Resources in China: Sheep and Goats. Beijing: China Agricultural Press. doi: 10.1186/1471-2105-14-S2-S4
• Cock P. J. A., Fields C. J., Goto N., Heuer M. L., Rice P. M. (2010). The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants. Nucleic Acids Res. 38 1767-1771. doi: 10.1093/nar/gkp1137

タイトルに関連する用語 (4件)： 胎児期 ,  ヤギ ,  第一胃 ,  環状RNA