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J-GLOBAL ID：202202269548619080   整理番号：22A0480599

SARS-CoV-2に応答する性特異的非コードRNAとネットワークへの新しい洞察【JST・京大機械翻訳】

A new insight into sex-specific non-coding RNAs and networks in response to SARS-CoV-2

著者 (3件)： Askari Nahid (Department of Biotechnology, Institute of Sciences and High Technology and Environmental Sciences, Graduate University of Advanced Technology, Kerman, Iran) ,  Hadizadeh Morteza (Physiology Research Center, Institute of Neuropharmacology, Kerman University of Medical Sciences, Kerman, Iran) ,  Rashidifar Maryam (Department of Plant Sciences and Biotechnology, Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, Tehran, Iran)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 97  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： SARS-CoV-2は,COVID-19に関与するRNAウイルスであり,その予後は,男性でわずかに悪いことが見出されている。本研究は,異なるmRNAとそれらの調節分子(miRNAsとlncRNAs)の発現を分析し,バイオインフォマティクス解析を用いて性特異的発現パターンとCOVID-19感受性の存在の可能性を考察した。SARS-CoV-2ゲノムヌクレオチド配列上の全てのヒト成熟miRNA配列の結合部位をmiRandaツールにより予測した。GSE157103からGalaxy webサーバを用いて配列決定データを発掘し,特徴計数の出力をDEseq2パッケージを用いて解析し,差次的発現遺伝子(DEG)を得た。遺伝子セット濃縮分析(GSEA)とDEGアノテーション分析を,ToppGenとMetascopeツールを用いて行った。RNAインターラクトームデータベースを用いて,差次的に発現したlncRNAと差次的に発現したmRNA間の相互作用を予測した。最後に,それらのネットワークをトップmiRNAで構築した。SARS-COVID-2ゲノム基準上の3から5結合部位を持つ11のmiRNAを同定した。miR-29c-3p,miR-21-3p,miR-6838-5pは4つの結合部位を占め,miR-29a-3pはSARS-CoV-2ゲノムに5つの結合部位を持っていた。さらに,miR-29a-3pおよびmiR-29c-3pは,DEGを標的とするトップmiRNAであった。miRNA(125,181b,130a,29a,b,c,212,181a,133a)の発現レベルは,COVID-19の雄で変化し,これらがACE2発現を調節し,ファゴソーム,補体活性化および細胞-マトリックス接着に影響することにより免疫応答に影響した。著者らの結果は,XIST lncRNAが上方制御され,TTTY14,TTTY10,およびZFY-AS1lncRNがCOVID-19のICUと非ICU男性の両方で下方制御されたことを示した。非コードRNAの調節不全は,COVID-19の男性の病態生理に決定的な影響を及ぼし,なぜそれらがバイオマーカーおよび治療薬として使用されるかである。全体として,著者らの結果は,miR-29ファミリー標的調節パターンを示し,COVID-19の男性における重症度および生存転帰に対する有望なバイオマーカーになるかもしれないことを示した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  ヌクレオチド配列 ,  ヒト ,  結合部位 ,  予後 ,  ダウンレギュレーション ,  バイオマーカー ,  アノテーション
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *非翻訳RNA ,  バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： COVID-19 ,  マイクロRNA ,  lncRNA ,  miR-29ファミリー

分類 (2件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： SARS-CoV-2 ,  応答 ,  性 ,  非コードRNA ,  洞察