動物DNAビロームの非従来型特性化のための家畜ゲノムデータセットのマイニング【JST・京大機械翻訳】

Bovo Samuele; Schiavo Giuseppina; Bolner Matteo; Ballan Mohamad; Fontanesi Luca

文献

J-GLOBAL ID：202202269867404556 整理番号：22A0944806

動物DNAビロームの非従来型特性化のための家畜ゲノムデータセットのマイニング【JST・京大機械翻訳】

Mining livestock genome datasets for an unconventional characterization of animal DNA viromes

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資料名：
巻： 114 号： 2 ページ： Null 発行年： 2022年
JST資料番号： T0422A ISSN： 0888-7543 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

個々の動物ゲノムの調査のために通常発生する全ゲノム配列決定(WGS)データセットは,それぞれの参照ゲノムに未マッピングのままである配列読取の分画の付加的マイニングに使用できる。これらの読み取りの有意な割合は,配列動物に感染したウイルスに由来するウイルスDNAを含む。本研究では,ウシ,ブタ,ニワトリおよびウサギから生産された1471WGSデータセットに由来する480億以上の配列決定読取をマイニングした。14,11,12および1がそれぞれウシ,ブタ,ニワトリおよびウサギに特異的に感染する367の異なるウイルスを同定した。それらのいくつかは,家畜とヒトの両方に対して遍在性,非病原性,高または潜在的損傷である。検索されたウイルスDNA情報は,動物食品生産システムに対する潜在的有害影響を有するいくつかのウイルスの分布を理解するために有用な家畜ビロームの最初の非在来型および日和見的景観を提供した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学

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