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J-GLOBAL ID：202202270561834533   整理番号：22A1176189

頭蓋内動脈瘤における小胞体ストレスの包括的解析【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Analysis of Endoplasmic Reticulum Stress in Intracranial Aneurysm

著者 (11件)： Chen Bo (Department of Neurosurgery, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Chen Bo (National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Zhou Hongshu (Department of Neurosurgery, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Zhou Hongshu (National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Zhou Xiaoxi (Department of Neurosurgery, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Zhou Xiaoxi (National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Yang Liting (Department of Neurosurgery, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Yang Liting (National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Xiong Yuanyuan (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Zhang Liyang (Department of Neurosurgery, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Zhang Liyang (National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China)
資料名： Frontiers in Cellular Neuroscience (Web)  (Frontiers in Cellular Neuroscience (Web))
巻： 16  ページ： 865005  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7064A  ISSN： 1662-5102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:異常な小胞体ストレス(ERS)は,複数の心血管疾患で重要な役割をする。しかし,頭蓋内動脈瘤(IAs)におけるそれらの含意は不明である。IAにおけるERSの一般的な発現パターンと潜在的機能を探索するために,本研究を設計した。【方法】5つの遺伝子発現Omnibus(GEO)マイクロアレイデータセットを訓練コホートとして使用し,3つのGEO RNA配列決定(RNA-seq)データセットを検証コホートとして使用した。差次的発現遺伝子(DEG),機能的濃縮,Lasso回帰,ロジスティック回帰,ROC分析,免疫細胞プロファイリング,血管平滑筋細胞(VSMC)表現型分析,加重遺伝子共発現ネットワーク分析(WGCNA),および蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)分析を適用して,IAにおけるERSの役割を調べた。最後に,上流転写因子(TF)/miRNAとERSを標的とする潜在的薬物を予測した。結果:有意なDEGはERS,オートファジーおよび代謝と大きく関連していた。IA形成中に8遺伝子ERSシグネチャとIRE1経路を同定した。WGCNAはERSがVSMC合成表現型と高度に関連することを示した。次に,ERS-VSMC-代謝-オートファジーPPIとERS-TF-miRNAネットワークを構築した。最後に,IAにおいてERSを標的化する9つの潜在的薬物を予測した。結論:ERSはIA形成に関与する。ERSに対する上流および下流調節ネットワークをIAにおいて同定した。ERSを標的化する新しい可能性のある薬剤も提案し,これはIA形成と進行を遅延させる。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  表現型 ,  母集団 ,  遺伝子発現 ,  ターゲティング ,  転写因子 ,  *小胞体ストレス ,  オートファジー
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  ロジスティック回帰分析 ,  IRE1 ,  共発現 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 頭蓋内動脈瘤 ,  小胞体ストレス ,  生物情報学 ,  薬物予測 ,  変性蛋白質応答

分類 (4件)： 循環系の基礎医学  (GJ01020K) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  神経系の疾患  (GN03000O)

引用文献 (62件)：

• Akerman A. W., Collins E. N., Peterson A. R., Collins L. B., Harrison J. K., DeVaughn A., et al (2021). miR-133a replacement attenuates thoracic aortic aneurysm in mice. J. Am. Heart Assoc. 10:e019862. doi: 10.1161/jaha.120.019862
• Appenzeller-Herzog C., Hall M. N. (2012). Bidirectional crosstalk between endoplasmic reticulum stress and mTOR signaling. Trends Cell Biol. 22 274-282. doi: 10.1016/j.tcb.2012.02.006
• Aran D., Hu Z., Butte A. J. (2017). xCell: digitally portraying the tissue cellular heterogeneity landscape. Genome Biol. 18:220. doi: 10.1186/s13059-017-1349-1
• Bailly-Maitre B., Belgardt B. F., Jordan S. D., Coornaert B., von Freyend M. J., Kleinridders A., et al (2010). Hepatic Bax inhibitor-1 inhibits IRE1alpha and protects from obesity-associated insulin resistance and glucose intolerance. J. Biol. Chem. 285 6198-6207. doi: 10.1074/jbc.M109.056648
• Biwer L. A., Good M. E., Hong K., Patel R. K., Agrawal N., Looft-Wilson R., et al (2018). Non-Endoplasmic reticulum-based calr (Calreticulin) can coordinate heterocellular calcium signaling and vascular function. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 38 120-130. doi: 10.1161/atvbaha.117.309886

タイトルに関連する用語 (3件)： 頭蓋内動脈瘤 ,  小胞体ストレス ,  解析