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J-GLOBAL ID：202202271000956177   整理番号：22A0105199

Pseudomonasの多様性と分類に光を当てる10種のゲノムのネットワーク解析【JST・京大機械翻訳】

Network analysis of ten thousand genomes shed light on Pseudomonas diversity and classification

著者 (4件)： Passarelli-Araujo Hemanoel (Departamento de Bioquimica e Imunologia, Instituto de Ciencias Biologicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil) ,  Passarelli-Araujo Hemanoel (Laboratorio de Quimica e Funcao de Proteinas e Peptideos, Centro de Biociencias e Biotecnologia, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, Campos dos Goytacazes, RJ, Brazil) ,  Franco Gloria Regina (Departamento de Bioquimica e Imunologia, Instituto de Ciencias Biologicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil) ,  Venancio Thiago M. (Laboratorio de Quimica e Funcao de Proteinas e Peptideos, Centro de Biociencias e Biotecnologia, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, Campos dos Goytacazes, RJ, Brazil)
資料名： Microbiological Research  (Microbiological Research)
巻： 254  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1209A  ISSN： 0944-5013  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 配列細菌ゲノムの成長は微生物多様性の評価を革命した。Pseudomonasは,254種以上を含む広く多様な属である。Pseudomonas多様性の推定にはタイプ株を用いたが,それらは属レベルでゲノム多様性の小さい画分を示す。210型株を含む10,035の利用可能なPseudomonasゲノムを用いて,ゲノム距離ネットワークを構築し,群落同定を通して種の数を推定した。著者らは,いくつかのタイプ株による分類学的不一致を同定し,Genbankに沈着したPseudomonasゲノムの25.65%が誤分類されていることを見出した。距離ネットワークにおける各種クラスタにおける代表的ゲノムからの単一コピー遺伝子を用いた系統樹は,ここで提案されたP.alcaligenes群を含む少なくとも14のPseudomonas群を明らかにした。Pseudomonasはおそらく異なる属の混和剤であり,さらに分割されるべきであることを示した。本研究は,誤標識Pseudomonasゲノムの伝播の低減を助けるかもしれないネットワークおよび系統ゲノム展望からのPseudomonas多様性の概観を提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  混和剤 ,  遺伝子 ,  系統樹 ,  *ゲノム ,  クラスタ ,  *Pseudomonas ,  群落
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  細菌ゲノム ,  ネットワーク解析 ,  分類学 ,  微生物多様性 ,  コミュニティ検出 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 系統ゲノミクス ,  シュードモナス ,  分類 ,  コミュニティ検出

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： Pseudomonas ,  多様性 ,  分類 ,  ゲノム ,  ネットワーク解析