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J-GLOBAL ID：202202271577767246   整理番号：22A0966691

Salmonella typhi XDR H-58株からの仮説蛋白質の治療機能を解読するための統合バイオインフォマティクスに基づくサブトラクティブゲノミクスアプローチ【JST・京大機械翻訳】

Integrated bioinformatics based subtractive genomics approach to decipher the therapeutic function of hypothetical proteins from Salmonella typhi XDR H-58 strain

著者 (2件)： Khan Kanwal (Dr. Panjwani Center for Molecular Medicine and Drug Research, International Center for Chemical and Biological Sciences, University of Karachi, Karachi, Pakistan) ,  Uddin Reaz (Lab 103, PCMD ext. Dr. Panjwani Center for Molecular Medicine and Drug Research, International Center for Chemical and Biological Sciences, University of Karachi, Karachi, Pakistan)
資料名： Biotechnology Letters  (Biotechnology Letters)
巻： 44  号： 2  ページ： 279-298  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0971A  ISSN： 0141-5492  CODEN： BILED3  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的:Salmonella感染に対する薬剤の効果は,新しいXDR H58株により損なわれている。SalmonellaのXDR株により治療する薬物候補と同様に,新規抗微生物薬標的を見つける必要がある。XDR H58株の完全なゲノム配列は,未知の細胞および生物学的機能を有する多数の仮想蛋白質を含むことが観察された。したがって,これらの蛋白質を機能的に,そして構造的に,新規薬物標的を同定するのに不可欠である。方法:本研究では,比較ゲノミクスおよびプロテオミクスに基づくアプローチを,Salmonella typhiのMDRおよびNR株を比較しながら,XDR株における新規薬物標的を見つけるために適用した。結果:ΔΨ350仮想蛋白質の特性化を,それらの物理化学的性質,サブ細胞局在性,機能的アノテーションおよび構造に基づく研究により決定した。結果として,5つの蛋白質だけが必須,薬物性,および毒性蛋白質として優先された。さらに,1つの蛋白質,すなわちWP_000916613.1は,高い信頼度で機能的に注釈付けされ,さらなる構造ベースの分析を受けた。結論:この研究は,新しい治療候補が予測される可能性のある薬理学的標的として,XDR S.typhiプロテオームからの仮説蛋白質を示す。現在の研究の結果は,Salmonellaだけでなく他の病原体の病原性における仮定的蛋白質の役割をより良く理解するためのパイプラインの一般的セットを定式化する。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature B.V. 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 抗微生物薬 ,  細胞 ,  *タンパク質 ,  病原性 ,  *サルモネラ属 ,  *腸チフス菌 ,  生物活性 ,  病原体 ,  薬理学 ,  定式化 ,  アノテーション ,  プロテオミクス ,  プロテオーム
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス ,  ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Salmonella typhi H58 ,  比較サブトラクティブゲノミクス ,  仮説蛋白質 ,  多剤耐性(MDR) ,  極限薬剤耐性(XDR) ,  非耐性(NR) ,  機能的アノテーション

分類 (2件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： Salmonella ,  仮説 ,  蛋白質 ,  治療 ,  解読 ,  統合 ,  バイオインフォマティクス