文献

J-GLOBAL ID：202202271907913041   整理番号：22A0838162

ERIC-PCRによる異なる臨床検体からのAcinetobacter baumannii分離株間のクローン関係【JST・京大機械翻訳】

Clonal relationship among Acinetobacter baumannii isolates from different clinical specimens by ERIC-PCR

著者 (7件)： Gautam H. (All India Institute Of Medical Sciences, New Delhi, Microbiology, New Delhi, India) ,  Maheshwari B. (All India Institute Of Medical Sciences, New Delhi, Microbiology, New Delhi, India) ,  Mohapatra S. (All India Institute Of Medical Sciences, New Delhi, Microbiology, New Delhi, India) ,  Sood S. (All India Institute Of Medical Sciences, New Delhi, Microbiology, New Delhi, India) ,  Dhawan B. (All India Institute Of Medical Sciences, New Delhi, Microbiology, New Delhi, India) ,  Kapil A. (All India Institute Of Medical Sciences, New Delhi, Microbiology, New Delhi, India) ,  Tezpur B. (All India Institute Of Medical Sciences, New Delhi, Microbiology, New Delhi, India)
資料名： International Journal of Infectious Diseases  (International Journal of Infectious Diseases)
巻： 116  号： S  ページ： S18-S19  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3271A  ISSN： 1201-9712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Acinetobacter baumanniiは,増加傾向で院内感染に関与する日和見病原体として同定されている。流行性クローンの循環を同定するために,腸内細菌反復遺伝子間コンセンサス(ERIC)-PCRに基づく遺伝子型決定パターンは有用である。A.baumanniiで見出された遺伝子の反復配列はDNAの非コード断片において見られ,これらの配列は配列特異的プライマーを用いてin vitroで増幅できる数及び長さにおいて可変であった。菌株のクラスターは,遺伝的関連性を決定する多様なパターンに従って,同様のグループにグループ分けできる。本研究は,インドのニューデリー(January-February 2021)のインド国立医学研究所の微生物学部門で実施した。異なる試料からのA.baumannii分離株を種々の病棟とICUから採取した。MALDI-TOF MSを用いて培養確認を行った。合計22のA.baumannii分離株を採取し,その内,胸膜液は(30%),CSF(27.5%)および腹水(42.5%)であった。抽出した細菌DNAをERIC-PCRフィンガープリンティングのために,以下のプライマーF:5’-ATGTAGCTCCTGGGATTCAC-3とR:5’AAGTAGTGACTGGGGGTGAGCG-3を用いて処理した。多重バンドサイズのフォーマットで得た結果とGel Analyzerソフトウェアを用いて分析した。クローン多様性を22のAcinetobacter baumanniiに対して決定し,15の異なるパターンを共通のERICパターンとして2つのパターンを含むERIC-PCR分析から得た。最も一般的なERICパターンはERICタイプ-1として指定され,比較的低い頻度に基づいて,ERICパターンはERICタイプ2,3などと指定された。ERICタイプ1は6つの分離株で同定され,ERICタイプ-2は3つの異なる分離株で同定された。類似性は4つのERICパターン,すなわちタイプ1と3の間で同定された。低レベルの類似性が4型と5型で同定された。ERICタイプ1パターンを表す全50%分離株は,脳脊髄液から33.3%であった。異なるERICパターンの存在は分離株をグループに分類し,共通のソースからの循環菌株の幾つかの広がりを暗示した。ほぼ類似したパターンを有する分離株は,患者と環境において発散する菌株の出現を示した。この情報は,異なる領域におけるクローンの同定にも役立つであろう。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *微生物 ,  DNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  クラスタ ,  腸内微生物 ,  ソフトウェア ,  病原体 ,  フィンガープリント法 ,  *Acinetobacter ,  *クローン ,  院内感染 ,  プライマー【遺伝】 ,  反復配列 ,  in vitro実験 ,  MALDI-TOF MS
準シソーラス用語： *Acinetobacter baumannii ,  腸内細菌 ,  *分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (5件)： ERIC-PCR ,  臨床検体 ,  Acinetobacter ,  株間 ,  クローン