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J-GLOBAL ID：202202272783446880   整理番号：22A0703304

核磁気共鳴により検出した溶液中の一本鎖DNAとデアミナーゼAPOBEC3Aの異なる2種類の相互作用モード【JST・京大機械翻訳】

Two different kinds of interaction modes of deaminase APOBEC3A with single-stranded DNA in solution detected by nuclear magnetic resonance

著者 (6件)： Liu Yaping (State Key Laboratory of Bioorganic and Natural Product Chemistry, Center for Excellence in Molecular Synthesis, Shanghai Institute of Organic Chemistry, Chinese Academy of Sciences, Shanghai, China) ,  Liu Yaping (University of Chinese Academy of Science, Beijing, China) ,  Lan Wenxian (State Key Laboratory of Bioorganic and Natural Product Chemistry, Center for Excellence in Molecular Synthesis, Shanghai Institute of Organic Chemistry, Chinese Academy of Sciences, Shanghai, China) ,  Wang Chunxi (State Key Laboratory of Bioorganic and Natural Product Chemistry, Center for Excellence in Molecular Synthesis, Shanghai Institute of Organic Chemistry, Chinese Academy of Sciences, Shanghai, China) ,  Cao Chunyang (State Key Laboratory of Bioorganic and Natural Product Chemistry, Center for Excellence in Molecular Synthesis, Shanghai Institute of Organic Chemistry, Chinese Academy of Sciences, Shanghai, China) ,  Cao Chunyang (University of Chinese Academy of Science, Beijing, China)
資料名： Protein Science  (Protein Science)
巻： 31  号： 2  ページ： 443-453  発行年： 2022年 
JST資料番号： W2730A  ISSN： 0961-8368  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： APOBEC3A(A3A)は一本鎖DNA(TC DNAと命名)の標的モチーフTCにおけるデオキシシチジンを脱アミノ化し,ウイルス病原体と免疫グロブリンを不死に変異させ,癌の多様化と致死をもたらす。A3A-DNAの結晶構造は,標的塩基dC_0のユニークなU型認識モードを明らかにした。しかし,TC DNAを15N標識A3A溶液に滴定すると,HSQCスペクトルにおけるA3Aの1H-15N交差ピークと二次元13C,15N-濾過TOCSYスペクトルにおけるDNAの1H-1H交差ピークの二つのセットを観測し,溶液中に存在するA3AまたはTC DNAの2つの異なる種類の配座異性体を示した。ここでは,主にNMRにより,1つのDNA配座異性体が1つのA3A配座異性体と相互作用し,特異的複合体A3AS-DNASを形成し,ここで報告された結晶A3A-DNA構造で観察されるものとほぼ類似した方法で,dC_0が亜鉛イオン結合中心に挿入されることを示した。他のDNA配座異性体は他のA3A配座異性体に結合したが,dC_0は亜鉛結合ポケットに伸長せず,非特異的A3ANS-DNANS複合体を形成した。NMR溶液構造は3部位Asn61,His182及びArg189がDNA認識に必要であることを示した。これらの観察は,X線結晶構造で報告されたものとは異なる方法を示し,溶液中のDNA中の標的モチーフTCを同定するためのデアミナーゼAPOBEC3Aの予想外のモードを示唆した。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結晶構造 ,  *相互作用 ,  ターゲット ,  亜鉛 ,  *DNA【核酸】 ,  免疫グロブリン ,  スペクトル ,  脱アミノ ,  結合部位 ,  複合体 ,  二次元 ,  *一本鎖DNA
準シソーラス用語： 配座異性体 ,  HSQC ,  亜鉛イオン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： APOBEC3A ,  DNA ,  同定 ,  核磁気共鳴 ,  構造

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (3件)： 核磁気共鳴 ,  溶液 ,  一本鎖DNA