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J-GLOBAL ID：202202272950020003   整理番号：22A0827420

乾燥ストレスに対する対照的な応答を持つヒヨコマメ栽培品種の再シークエンシングによるDNA多型のゲノムワイド発見【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide discovery of DNA polymorphisms via resequencing of chickpea cultivars with contrasting response to drought stress

著者 (3件)： Rajkumar Mohan Singh (School of Computational & Integrative Sciences, Jawaharlal Nehru University, New Delhi, India) ,  Garg Rohini (Department of Life Sciences, School of Natural Sciences, Shiv Nadar University, Gautam Buddha Nagar, India) ,  Jain Mukesh (School of Computational & Integrative Sciences, Jawaharlal Nehru University, New Delhi, India)
資料名： Physiologia Plantarum  (Physiologia Plantarum)
巻： 174  号： 1  ページ： e13611  発行年： 2022年 
JST資料番号： C0602A  ISSN： 0031-9317  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 干ばつストレスは植物成長を制限し,ヒヨコマメの顕著な収量損失をもたらす。作物植物の異なる遺伝子型における対立遺伝子(s)のゲノム配列と選択的スイープにおける多様化は,干ばつストレス応答を含む農業形質の決定において重要な役割を果たす可能性がある。全ゲノム再配列決定を通して,対照的な干ばつストレス応答(3つの干ばつ感受性対6干ばつ耐性)を有するヒヨコマメ遺伝子型の2セット間のDNA多型を調べた。全体で,36,406の一塩基多型(SNP)と3407の挿入または欠失(InDels)は,乾燥感受性と耐干性ヒヨコマメ遺伝子型を区別した。興味深いことに,これらのDNA多型の大部分(91%)は染色体1と4に位置した。プロモーターおよび/またはコード領域にDNA多型を持つ遺伝子,および乾燥感受性および耐性遺伝子型間の対照および/または干ばつストレス条件下で異なる発現を示す遺伝子を,ストレス応答に関与することを見出した。さらに,著者らは,非生物ストレス関連およびQTL関連遺伝子のプロモーター領域におけるシス調節モチーフ内のDNA多型を同定し,それは候補乾燥応答遺伝子の差次的発現に寄与する可能性がある。さらに,非同義SNPがコード蛋白質の変異感受性と安定性に及ぼす影響を明らかにした。まとめると,著者らは,干ばつストレス応答における関連性を持つDNA多型を同定し,ヒヨコマメにおける耐干性を操作する候補遺伝子を明らかにした。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *応答 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  *ストレス ,  タンパク質 ,  植物成長 ,  干ばつ ,  *ヒヨコマメ ,  対立遺伝子 ,  プロモーター領域 ,  *栽培品種
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  *DNA多型 ,  候補遺伝子 ,  非生物的ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (9件)： 乾燥ストレス ,  対照 ,  応答 ,  ヒヨコマメ ,  栽培品種 ,  シークエンシング ,  DNA多型 ,  ゲノム ,  発見