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J-GLOBAL ID：202202272978639400   整理番号：22A0974208

PPI-Hotspot Overhaus:蛋白質-蛋白質相互作用ホットスポットのデータベース【JST・京大機械翻訳】

PPI-Hotspot^DB: Database of Protein-Protein Interaction Hot Spots

著者 (5件)： Chen Yao Chi (Institute of Biomedical Sciences, Academia Sinica, Taiwan) ,  Chen Yu-Hsien (Institute of Biomedical Sciences, Academia Sinica, Taiwan) ,  Wright Jon D. (Institute of Biomedical Sciences, Academia Sinica, Taiwan) ,  Lim Carmay (Institute of Biomedical Sciences, Academia Sinica, Taiwan) ,  Lim Carmay (Department of Chemistry, National Tsing Hua University, Taiwan)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 62  号： 4  ページ： 1052-1060  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ある種の残基の単一点突然変異(いわゆるホットスポット)は,病因と薬剤耐性を導く,蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)を障害/破壊する。従来,PPI-ホットスポットは,その置換が結合自由エネルギーを,一般に≧2kcal/molと大きく減少させる時に同定される。そのような有意な結合自由エネルギー低下による比較的少数の突然変異は,異なるPPI-ホットスポットの数を制限した。UniProtKBで手動で切断された変異に基づくPPI-ホットスポットを,結合自由エネルギー変化に加えて,有意に損傷/破壊PPIに限定することにより,異なるPPI-ホットスポット数を1桁大きく拡大した。これらの実験的に決定したPPI-ホットスポットを,PPI-HotスポットDBと呼ばれるデータベースで集めた。PPI-HotスポットDBを適用して,入力として自由構造を用いてPPI-ホットスポットを予測する方法を評価するために,非冗長ベンチマークPPI-Hotスポット+PDBBMを作成した。PPI-HotスポットDBは,変異誘発実験の設計およびPPI-ホットスポット予測法の開発に役立つであろう。データベースとベンチマークはhttps://ppihotspot.limlab.dnsalias.orgで自由に利用可能である。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 自由エネルギー ,  予測技法 ,  冗長性 ,  *データベース ,  突然変異 ,  薬物耐性 ,  変異誘発 ,  *ホットスポット ,  ベンチマーク ,  病因
準シソーラス用語： *蛋白質間相互作用 ,  結合自由エネルギー ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： PPI ,  蛋白質-蛋白質相互作用 ,  ホットスポット ,  データベース