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J-GLOBAL ID：202202273357282577   整理番号：22A0835402

膵管腺癌におけるmiRNA仲介遺伝子調節による一塩基多型の干渉の調査:in silicoアプローチ【JST・京大機械翻訳】

Investigating the interference of single nucleotide polymorphisms with miRNA mediated gene regulation in pancreatic ductal adenocarcinoma: An in silico approach

著者 (3件)： Mukherjee Moumita (National Institute of Biomedical Genomics, Kalyani, West Bengal, India) ,  Ghosh Satyajit (Indian Institute of Technology-Jodhpur, Jodhpur, India) ,  Goswami Srikanta (National Institute of Biomedical Genomics, Kalyani, West Bengal, India)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 819  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 膵管腺癌(PDAC)は,重要な遺伝子における強い遺伝的成分および一塩基多型(SNPs)を有し,疾患に対する個体の感受性を調節することが見出されている。標的遺伝子またはmiRNA種子領域の3′-UTRにおけるSNPは,miRNA-mRNA相互作用の障害をもたらすので,非常に重要性を獲得した。この現象に関する多くの情報はPDACに関して入手できず,著者らはバイオインフォマティクスツールを用いて疾患におけるmiRNA機能に影響を及ぼすことができるそのようなSNPの予測を望んだ。PDACにおける脱調節miRNAと遺伝子を同定した後,これらの変異遺伝子のどれがそれらのmiRNAの実験的に検証された標的であるかを決定した。その後,これらのmiRNA-mRNA相互作用を変えることができるSNPを,高い厳しい条件に従って多重ウェブツールを用いて検出した。SNPの疾患関連性も評価した。PDACで脱調節した303のmiRNAに対する全部で2492の実験的に検証された標的遺伝子を同定した。363のPDAC患者と162人の対照個体からの著者らのメタ分析は,膵臓癌で差別的に発現された遺伝子のセットをもたらし,さらに,膵臓癌で差次的に発現した標的を得るために,miRNA標的遺伝子と比較した。さらに,miRNA結合部位の分裂または生成のいずれかを有するmRNAのmiRNAまたはΔΨ種子-マッチ配列のいずれかにおけるSNPを,各miRNA-SNP-mRNA相互作用に対する発現に相関させた。選択したSNPは,重要なGWASがSNPを同定したLDにあることを見出した。本研究では,miRNA標的mRNA相互作用に対するSNPのありそうな影響を検討した。厳密な分析法により,PDACにおけるmiRNA仲介遺伝子調節を妨害する3つの共通変異体と13の他の希少変異体を同定した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *干渉 ,  相互作用 ,  mRNA ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  多重化 ,  結合部位 ,  *遺伝的調節 ,  膵臓腫瘍 ,  *一塩基多型 ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  バイオインフォマティクス ,  標的遺伝子 ,  *膵管腺癌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 膵管腺癌 ,  単一ヌクレオチド多型 ,  マイクロRNA ,  干渉

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 膵管腺癌 ,  miRNA ,  仲介 ,  遺伝子調節 ,  一塩基多型 ,  干渉 ,  調査