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J-GLOBAL ID：202202273509046981   整理番号：22A0807707

「球状ウシ」モデルによる生体分子拡散の定量化【JST・京大機械翻訳】

Quantifying biomolecular diffusion with a “spherical cow” model

著者 (5件)： Freitas Frederico Campos (Laboratorio de Biofisica Teorica, Departamento de Fisica, Instituto de Ciencias Exatas, Naturais e Educacao, Universidade Federal do Triangulo Mineiro, Uberaba, MG, Brazil) ,  Byju Sandra (Department of Physics and Center for Theoretical Biological Physics, Northeastern University, 360 Huntington Avenue, Boston, Massachusetts 02115) ,  Hassan Asem (Department of Physics and Center for Theoretical Biological Physics, Northeastern University, 360 Huntington Avenue, Boston, Massachusetts 02115) ,  Oliveira Ronaldo Junio de (Laboratorio de Biofisica Teorica, Departamento de Fisica, Instituto de Ciencias Exatas, Naturais e Educacao, Universidade Federal do Triangulo Mineiro, Uberaba, MG, Brazil) ,  Whitford Paul C. (Department of Physics and Center for Theoretical Biological Physics, Northeastern University, 360 Huntington Avenue, Boston, Massachusetts 02115)
資料名： American Journal of Physics  (American Journal of Physics)
巻： 90  号： 3  ページ： 225-238  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0379A  ISSN： 0002-9505  CODEN： AJPIAS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質,RNA,およびDNAを含む生物学的ポリマーの動力学は,非常に高次元のスペースで起こる。多くの自然発生高分子は,広大な相空間をナビゲートし,それらの最低自由エネルギー(折畳み)状態を迅速に見つけることができる。したがって,探索プロセスは確率的であるが,完全にランダムではない。代わりに,それは下り坂エネルギー景観に沿った拡散に関して最もよく記述される。この文脈において,ポテンシャルエネルギーが折畳み状態に対応する大域的最小を持つ比較的滑らかな関数になるように選択されるエネルギー論の単純化表現を使用する多くの努力があった。すなわち,あらゆるタイプの物理的相互作用を含む代わりに,景観の幅広い特性を近似エネルギー関数で符号化した。構造に基づくモデルと呼ばれる特定のクラスのモデルを記述し,生体分子折畳みと立体配座再配列の拡散特性を探索するために使用できる。これらのエネルギー関数は,分子生物物理学をモデル化するための球状牛と見なされる。これらのモデルの根底にある物理的原理を議論し,物理学と非物理学の大多数のためのカリキュラムでの使用に適応できる侵入レベルのチュートリアルを提供した。Copyright 2022 AIP Publishing LLC All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 自由エネルギー ,  *分子 ,  立体配座 ,  エネルギー ,  簡素化 ,  景観 ,  DNA【核酸】 ,  RNA【核酸】 ,  近似法 ,  モデリング ,  折畳み ,  カリキュラム ,  *モデル
準シソーラス用語： エネルギー関数 ,  *生体分子 ,  再配列 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： 球状 ,  ウシ ,  モデル ,  生体分子 ,  拡散 ,  定量化