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J-GLOBAL ID：202202273540423479   整理番号：22A0329327

パネルベースハイブリッド捕捉次世代シークエンシングによる造血新生物のルーチン分子プロファイリングにおけるEpstein-Barrウイルス由来DNAの定量的オフターゲット検出【JST・京大機械翻訳】

Quantitative Off-Target Detection of Epstein-Barr Virus-Derived DNA in Routine Molecular Profiling of Hematopoietic Neoplasms by Panel-Based Hybrid-Capture Next-Generation Sequencing

著者 (14件)： Petrova-Drus Kseniya (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Quesada Andres E. (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Bowman Anita S. (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Ptashkin Ryan (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Yao Jinjuan (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Arcila Maria E. (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Ho Caleb (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Moung Christine (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Regalado Jennifer (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Benayed Ryma (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Benhamida Jamal K. (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Galera Pallavi K. (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Dogan Ahmet (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York) ,  Vanderbilt Chad (Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, New York)
資料名： Journal of Molecular Diagnostics  (Journal of Molecular Diagnostics)
巻： 24  号： 1  ページ： 69-78  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3144A  ISSN： 1525-1578  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Epstein-Barrウイルス(EBV)は血液学的および固形腫瘍と関連する。EBV基準コンティグ(NC_007605)に整列する非標的ウイルス由来EBV読取を検出し,定量するために,血液学的悪性腫瘍と関連する400遺伝子を標的化するハイブリダイゼーション捕獲に基づく次世代シークエンシング(NGS)プラットフォームを利用した。血液学的新生物を有する3636人のユニークな患者から5234のサンプルを評価し,93のユニークな患者における100のサンプル(1.9%)が≧6EBV読み取り(範囲,6から32,325;平均,827.5;中央値,54)を有することを見出した。大部分の(n=73,73%)は既知のEBV関連条件を表し,最も一般的なものは移植後リンパ増殖性疾患(n=21,29%)であった。EBVウイルス血症は27検体中4例で,EBV関連が適度で,EBV関連は知られていないが,ウイルス血症または低レベル活性化は残りの23試料であった。良好な相関(Spearman r=0.8;95%CI,0.74~0.85)が,NGSによるEBV読取と162の利用可能な試料,特により大きなEBV関与で,系統的半定量的EBVコード化RNAin situハイブリダイゼーションの間に見出された。有意な形態学的EBV関与に対する最適閾値は,受信者動作特性分析(曲線下面積,0.990;95%CI,0.9974%~1.00%)により≧10読み取りであった。したがって,変異解析に加えて,ハイブリッド捕獲に基づくNGSパネルは,形態と良く相関するオフターゲットEBV由来ウイルスDNAを検出し,定量することができる。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *腫瘍 ,  *造血 ,  *捕獲 ,  分子ハイブリダイゼーション ,  ターゲティング ,  ウイルス血症 ,  モルフォロジー ,  固形腫瘍
準シソーラス用語： ウイルスDNA ,  悪性腫瘍 ,  *分子診断 ,  変異解析 ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  腫ようの放射線療法  (GE03034K)

タイトルに関連する用語 (9件)： 捕捉 ,  次世代シークエンシング ,  造血 ,  新生物 ,  ルーチン ,  分子プロファイリング ,  Epstein-Barrウイルス ,  DNA ,  定量