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J-GLOBAL ID：202202273863621591   整理番号：22A1177618

ヒト腸マイクロバイオームからのグリコシド輸送体の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Glycoside Transporters From the Human Gut Microbiome

著者 (4件)： Wang Zhi (TBI, CNRS, INRA, INSAT, Universite de Toulouse, Toulouse, France) ,  Tauzin Alexandra S. (TBI, CNRS, INRA, INSAT, Universite de Toulouse, Toulouse, France) ,  Laville Elisabeth (TBI, CNRS, INRA, INSAT, Universite de Toulouse, Toulouse, France) ,  Potocki-Veronese Gabrielle (TBI, CNRS, INRA, INSAT, Universite de Toulouse, Toulouse, France)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 13  ページ： 816462  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 輸送は細菌によるグリコシドの代謝における重要な段階であり,それは微生物叢機能および平衡の鍵である。しかし,ほとんどの輸送蛋白質は機能未知であるか予測され,細菌がグリコシドを利用する方法の理解を制限する。ここでは,ミクロビオームから機能的グリコシド輸送体を同定する活性に基づくスクリーニング法を示した。この方法は,ホスミドでクローン化されたメタゲノム多糖類利用遺伝子座(PULs)から輸送体および炭水化物活性酵素(CAZyme)をコードする遺伝子の大腸菌における共発現に基づいている。方法論の概念の証明を確立するために,ヒト腸微生物叢由来の2つの異なるメタゲノムライブラリーを用い,そのメタゲノム配列が少なくとも1つの推定グリコシド輸送体と1つの機能的CAZymeを含む18の大腸菌クローンを選択し,種々のグリコシドヒドロラーゼ活性のスクリーニングにより同定した。各PULで同定されたCAZymeの標的基質である植物由来グリコシドについて成長試験を行った。これは,PTS,ABC,MFSおよびSusCDファミリーからの輸送体の生産により,唯一の炭素源としてオリゴ糖を利用できる10クローンの同定につながった。10のヒットクローンのうちの6つは1つの輸送体のみを含み,これらの輸送体が機能的である直接的な実験的証拠を提供する。2つの輸送体がクローンの配列に存在する6つの場合において,輸送体の機能は隣接CAZymeから,または以前に特性化された輸送体との類似性から予測でき,それはさらなる機能的特性化を促進する。結果は,グリコシドが細菌により選択的に代謝される方法の理解を拡大し,明確な構造を有するオリゴ糖に対するグリコシド-輸送体特異性のスクリーニングへの新しいアプローチを提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 大腸菌 ,  遺伝子 ,  栄養素 ,  基質 ,  グリコシド結合ヒドロラーゼ ,  ヒト ,  *グリコシド ,  少糖類 ,  *膜タンパク質 ,  ミクロフローラ ,  クローン ,  スクリーニング ,  遺伝子発現 ,  遺伝子ライブラリー
準シソーラス用語： *輸送体 ,  炭素源 ,  共発現 ,  メタゲノム ,  メタゲノムライブラリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： マイクロバイオーム ,  オリゴ糖 ,  CAZymes ,  機能的メタゲノミクス ,  トランスポーター

分類 (5件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物検査法  (EG02020G) ,  酵素一般  (EB09010D)

引用文献 (45件)：

• Bindels L. B., Delzenne N. M., Cani P. D., Walter J. (2015). Towards a more comprehensive concept for prebiotics. Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. 12 303-310. doi: 10.1038/nrgastro.2015.47
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• Boratyn G. M., Camacho C., Cooper P. S., Coulouris G., Fong A., Ma N., et al (2013). BLAST: a more efficient report with usability improvements. Nucleic Acids Res. 41 29-33. doi: 10.1093/nar/gkt282
• Cao Y., Jin X., Levin E. J., Huang H., Zong Y., Quick M., et al (2011). Crystal structure of a phosphorylation-coupled saccharide transporter. Nature 473 50-54. doi: 10.1038/nature09939
• Cecchini D. A., Laville E., Laguerre S., Robe P., Leclerc M., Doré J., et al (2013). Functional Metagenomics reveals novel pathways of prebiotic breakdown by human gut bacteria. PLoS One 8:e72766. doi: 10.1371/journal.pone.0072766

タイトルに関連する用語 (6件)： ヒト ,  腸 ,  マイクロバイオーム ,  グリコシド ,  輸送体 ,  同定