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J-GLOBAL ID：202202273964219488   整理番号：22A1039395

RNAシークエンシングによる酸素誘導網膜症によるマウス網膜のマイクロRNA発現解析【JST・京大機械翻訳】

MicroRNA Expression Analysis of Mice Retinas with Oxygen-Induced Retinopathy by RNA Sequencing

著者 (9件)： Chen Xiuping (Department of Ophthalmology, Zhongshan Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Li Xianglian (Department of Ophthalmology, Zhongshan Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Liu Yan (Department of Ophthalmology, Ninth People’s Hospital, Shanghai JiaoTong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Yuan Yuanzhi (Department of Ophthalmology, Zhongshan Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Feng Yifan (Department of Ophthalmology, Zhongshan Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Wang Jing (Department of Ophthalmology, Zhongshan Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Li Min (Department of Ophthalmology, Zhongshan Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Gao Dongmei (Liver Cancer Institute, Zhongshan Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Yuan Fei (Department of Ophthalmology, Zhongshan Hospital of Fudan University, Shanghai, China)
資料名： Journal of Ophthalmology (Web)  (Journal of Ophthalmology (Web))
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7782A  ISSN： 2090-004X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的.RNA配列決定により酸素誘導網膜症を有するマウスの網膜におけるマイクロRNA(miRNA)発現プロファイルを特性化し,網膜血管新生と関連するmiRNAを確かめる。【方法】網膜サンプルを,OIRマウスの3群(6網膜/群)とP17の正常マウスから得た。RNAを24の網膜試料から分離し,Illumina HiSeqで検出した。12の網膜試料を定量的ポリメラーゼ連鎖反応に用い,RNA配列決定を検証した。バイオインフォマティクス分析を行った。結果.RNA配列は,565のmiRNAが正常対照マウスの網膜でOIRマウスの網膜と583のmiRNAで検出されたことを示した。全部で553のmiRNAを両群で発現させた。38のmiRNAは,両群([数式:原文を参照])で変化した発現を示した。対照群と比較して,2つのmiRNAはOIR群で有意に上方制御されたが,36のmiRNAは有意に減少した。一方,miRNA発現([数式:原文を参照])における有意差を有する2つの候補miRNA(miR-181a-5pおよびmiR-21a-5p)を,検証のために選択した。定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(qRT-PCR)を用いて,2つのmiRNAの相対的発現を確認した。バイオインフォマティクス解析は,虚血性網膜症に関与する経路(TGF-β,Ras,Hippo,PI3K-Akt,VEGF,およびHIF-1シグナル伝達経路など)が豊富であることを示した。結論.本研究は,OIR網膜におけるmiRNAプロファイリングの全体的見解を提供した。これらのmiRNAプロフィールは,網膜血管新生の潜在的治療法のための貴重なフレームワークを提供する。Copyright 2022 Xiuping Chen et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *網膜 ,  情報科学 ,  *酸素 ,  生物学 ,  *RNA【核酸】 ,  *マウス ,  *網膜症 ,  網膜疾患 ,  アップレギュレーション ,  PCR法 ,  *アンチセンスRNA
準シソーラス用語： 網膜血管新生 ,  *マイクロRNA ,  *遺伝子発現プロファイリング ,  バイオインフォマティクス ,  低酸素誘導性因子1 ,  定量的リアルタイムPCR法 ,  *RNA-seq ,  遺伝子プロファイル , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 眼の基礎医学  (GP01020C)

引用文献 (44件)：

• J. Lechner, O. E. O’Leary, A. W. Stitt, "The pathology associated with diabetic retinopathy," Vision Research, vol. 139, pp. 7-14, 2017.
• J. C. Rivera, A. Madaan, T. E. Zhou, S. Chemtob, "Review of the mechanisms and therapeutic avenues for retinal and choroidal vascular dysfunctions in retinopathy of prematurity," Acta Paediatrica, vol. 105, no. 12, pp. 1421-1433, 2016.
• J. C. Rivera, R. Dabouz, B. Noueihed, S. Omri, H. Tahiri, S. Chemtob, "Ischemic retinopathies: oxidative stress and inflammation," Oxidative Medicine and Cellular Longevity, vol. 2017, pp. 16, 2017.
• W.-C. Wu, C.-P. Shih, N.-K. Wang, R. Lien, Y.-P. Chen, A.-N. Chao, K.-J. Chen, T.-L. Chen, Y.-S. Hwang, C.-C. Lai, C.-Y. Huang, S. Tsai, "Choroidal thickness in patients with a history of retinopathy of prematurity," JAMA Ophthalmology, vol. 131, no. 11, pp. 1451-1458, 2013.
• J. T. Brash, R. L. Bolton, V. S. Rashbrook, L. Denti, Y. Kubota, C. Ruhrberg, "Tamoxifen-activated creERT impairs retinal angiogenesis independently of gene deletion," Circulation Research, vol. 127, no. 6, 2020.

タイトルに関連する用語 (8件)： RNAシークエンシング ,  酸素 ,  誘導 ,  網膜症 ,  マウス ,  網膜 ,  マイクロRNA ,  発現解析