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J-GLOBAL ID：202202274120807401   整理番号：22A1177988

完全長トランスクリプトーム解析はPortunus trituberculatusにおける免疫関連遺伝子の多様性に新しい洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Full-Length Transcriptome Analysis Provides New Insights Into the Diversity of Immune-Related Genes in Portunus trituberculatus

著者 (7件)： Zhang Yi (1School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo, China) ,  Ni Mengqi (1School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo, China) ,  Bai Yunhui (1School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo, China) ,  Shi Qiao (1School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo, China) ,  Zheng Jinbin (1School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo, China) ,  Cui Zhaoxia (1School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo, China) ,  Cui Zhaoxia (2Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Pilot Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology (Qingdao), Qingdao, China)
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 13  ページ： 843347  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 一般的に,無脊椎動物は,侵入微生物と戦うために,それらの非特異的自然免疫系のみに依存すると考えられた。しかし,研究は,無脊椎動物の先天性免疫応答が生物における超可変免疫分子のために多様性と特異性を示すことを意味した。Portunus trituberculatusにおける免疫関連遺伝子の多様性への洞察を得るために,P.trituberculatusにおけるいくつかの免疫関連組織(赤血球,肝膵臓および鰓)の完全長トランスクリプトーム分析を行い,いくつかの免疫関連遺伝子の多様性を分析した。P.trituberculatusの完全長トランスクリプトーム解析を,SMRT長読取配列とIllumina短読取配列の組合せを用いて行った。全部で17433の非冗長完全長転写物が,平均長さ2,271bpとN50長さ2,841bpで得られ,そのうち13,978(80.18%)転写物が注釈された。さらに,プロフェノールオキシダーゼ(proPO)活性化システムにおけるパターン認識受容体,抗菌ペプチド,熱ショック蛋白質(HSPs),抗酸化酵素および生命分子を含む,種々の免疫関連遺伝子の多数の転写産物変異体を同定した。完全長トランスクリプトーム分析に基づいて,4つのC型レクチン(CTLs)のオープンリーディングフレーム(ORF)をクローン化し,組織分布から,4つのCTLsがすべての試験組織で遍在的に発現し,主に肝膵臓と鰓で発現することを示した。4つのCTLの転写は,Vibrio alginolyticusでチャレンジしたP.trituberculatusのいくつかの免疫関連組織(血球,肝膵臓および鰓)で有意に増加し,異なるプロフィールを示した。さらに,4つのCTLは明確な細菌結合と抗菌活性を示した。組換蛋白質PtCTL-1(rPtCTL-1)とrPtCTL-3は細菌結合を示し,rPtCTL-2はV.alginolyticusに対して細菌結合と抗菌活性のみを示した。PtCTL-4に対する明らかな細菌結合または抗菌活性は,試験した細菌に対して観察されなかった。本研究は,P.trituberculatusのトランスクリプトーム情報を豊かにし,甲殻類の先天性免疫系への新しい洞察を提供する。さらに,著者らの研究は,細菌症の予防と治療に対する抗生物質の候補を提供した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  *遺伝子 ,  抗細菌作用 ,  抗生物質 ,  生体内分布 ,  転写【遺伝】 ,  *免疫 ,  細菌感染症 ,  レクチン ,  *ガザミ ,  クローン ,  *トランスクリプトーム ,  自然免疫
準シソーラス用語： 肝膵臓 ,  オープンリーディングフレーム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Portunus trituberculatus ,  完全長トランスクリプトーム ,  自然免疫 ,  転写産物変異体 ,  c型レクチン

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (74件)：

• MOA (Ministry of Agriculture). China Fishery Statistical Yearbook. Beijing, China: China Agriculture Press (2021). (in Chinese with English abstract).
• Jayasree L, Janakiram P, Madhavi R. Characterization of Vibrio Spp. Associated With Diseased Shrimp From Culture Ponds of Andhra Pradesh (India). J World Aquacult Soc (2006) 37:523-32. doi: doi: 10.1111/j.1749-7345.2006.00066.x
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• Kumar BK, Deekshit VK, Raj JRM, Rai P, Shivanagowda BM, Karunasagar I, et al. Diversity of Vibrio Parahaemolyticus Associated With Disease Outbreak Among Cultured Litopenaeus Vannamei (Pacific White Shrimp) in India. Aquaculture (2014) 433:247-51. doi: doi: 10.1016/j.aquaculture.2014.06.016
• Chen LL, Lo CF, Chiu YL, Chang CF, Kou GH. Natural and Experimental Infection of White Spot Syndrome Virus (WSSV) in Benthic Larvae of Mud Crab Scylla Serrata. Dis Aquat Organ (2000) 40:157-61. doi: doi: 10.3354/dao040157

タイトルに関連する用語 (5件)： トランスクリプトーム解析 ,  免疫 ,  遺伝子 ,  多様性 ,  洞察