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J-GLOBAL ID：202202275115710256   整理番号：22A0429757

ヒトインタラクトームにおける相分離蛋白質の特徴的なネットワークトポロジー【JST・京大機械翻訳】

Distinctive Network Topology of Phase-Separated Proteins in Human Interactome

著者 (8件)： Yu Chunyu (Department of Biomedical Informatics, School of Basic Medical Sciences, Peking University Health Science Center, Beijing 100191, China) ,  Yu Chunyu (Institute of Systems Biomedicine, School of Basic Medical Sciences, Peking University Health Science Center, Beijing 100191, China) ,  Lang Yunzhi (Department of Biomedical Informatics, School of Basic Medical Sciences, Peking University Health Science Center, Beijing 100191, China) ,  Lang Yunzhi (Institute of Systems Biomedicine, School of Basic Medical Sciences, Peking University Health Science Center, Beijing 100191, China) ,  Hou Chao (Department of Biomedical Informatics, School of Basic Medical Sciences, Peking University Health Science Center, Beijing 100191, China) ,  Yang Ence (Department of Biomedical Informatics, School of Basic Medical Sciences, Peking University Health Science Center, Beijing 100191, China) ,  Ren Xianwen (Beijing Advanced Innovation Centre for Genomics, Peking-Tsinghua Centre for Life Sciences, Biomedical Pioneering Innovation Center (BIOPIC), School of Life Sciences, Peking University, Beijing 100871, China) ,  Li Tingting (Department of Biomedical Informatics, School of Basic Medical Sciences, Peking University Health Science Center, Beijing 100191, China)
資料名： Journal of Molecular Biology  (Journal of Molecular Biology)
巻： 434  号： 1  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： D0124B  ISSN： 0022-2836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 液-液相分離(LLPS)は,生体分子凝縮物の形成を仲介する重要な機構である。LLPSにおける大きな興味にもかかわらず,実験によって検証された相分離蛋白質は,まだ制限され,プロテオーム規模での相分離蛋白質の同定は,挑戦的な仕事である。巨大分子間の多価相互作用はLLPSの駆動力であり,相分離蛋白質は蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)において異なる生物学的特徴を有することを示唆した。本研究では,統合ヒトPPIネットワーク(HPIN)を構築し,その中に相分離蛋白質をマッピングした。ネットワークパラメータの解析は,相分離蛋白質と他の間のネットワークトポロジーの違いを明らかにした。結果はさらに,MLOの成分を区別する際にトポロジー類似性を適用するときの効率を示唆した。さらに,アフィニティー精製質量分析(AP-MS)は,相分離駆動凝縮物中の酵母-2ハイブリッド系(Y2H)よりもPPIsをより効果的に検出することを見出した。本研究は,ヒトインタラクトームにおける相分離蛋白質の異なるネットワークトポロジーの最初の全体的見解を提供し,さらなる研究におけるLLPS予測に対するPPIネットワークの取り込みを示唆した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *位相幾何学 ,  質量分析 ,  相互作用 ,  *ネットワーク ,  *相分離 ,  酵母 ,  *タンパク質 ,  ヒト ,  *タンパク質分離物 ,  プロテオーム
準シソーラス用語： 蛋白質間相互作用 ,  *ネットワークトポロジー ,  生体分子 ,  *インタラクトーム ,  巨大分子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 相分離 ,  蛋白質-蛋白質相互作用 ,  無膜オルガネラ ,  ネットワーククラスタリング ,  ノード埋込み

分類 (1件)： 生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (3件)： 相分離 ,  蛋白質 ,  ネットワークトポロジー