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J-GLOBAL ID：202202275138918016   整理番号：22A1024844

ゲノムとトランスクリプトーム解析に基づく「Handou10」におけるダイズシストセンチュウ抵抗性を制御する候補遺伝子の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Candidate Genes Controlling Soybean Cyst Nematode Resistance in “Handou 10” Based on Genome and Transcriptome Analyzes

著者 (11件)： Wei He (Henan Academy of Crops Molecular Breeding, Henan Academy of Agricultural Sciences/National Centre for Plant Breeding/Zhengzhou Subcenter of National Soybean Improvement Center/Key Laboratory of Oil Crops in Huanghuaihai Plains of Ministry of Agriculture, Zhengzhou, China) ,  Lian Yun (Henan Academy of Crops Molecular Breeding, Henan Academy of Agricultural Sciences/National Centre for Plant Breeding/Zhengzhou Subcenter of National Soybean Improvement Center/Key Laboratory of Oil Crops in Huanghuaihai Plains of Ministry of Agriculture, Zhengzhou, China) ,  Li Jinying (Henan Academy of Crops Molecular Breeding, Henan Academy of Agricultural Sciences/National Centre for Plant Breeding/Zhengzhou Subcenter of National Soybean Improvement Center/Key Laboratory of Oil Crops in Huanghuaihai Plains of Ministry of Agriculture, Zhengzhou, China) ,  Li Haichao (Henan Academy of Crops Molecular Breeding, Henan Academy of Agricultural Sciences/National Centre for Plant Breeding/Zhengzhou Subcenter of National Soybean Improvement Center/Key Laboratory of Oil Crops in Huanghuaihai Plains of Ministry of Agriculture, Zhengzhou, China) ,  Song Qijian (Soybean Genomics and Improvement Laboratory, USDA-ARS, Beltsville, MD, United States) ,  Wu Yongkang (Henan Academy of Crops Molecular Breeding, Henan Academy of Agricultural Sciences/National Centre for Plant Breeding/Zhengzhou Subcenter of National Soybean Improvement Center/Key Laboratory of Oil Crops in Huanghuaihai Plains of Ministry of Agriculture, Zhengzhou, China) ,  Lei Chenfang (Henan Academy of Crops Molecular Breeding, Henan Academy of Agricultural Sciences/National Centre for Plant Breeding/Zhengzhou Subcenter of National Soybean Improvement Center/Key Laboratory of Oil Crops in Huanghuaihai Plains of Ministry of Agriculture, Zhengzhou, China) ,  Wang Shiwei (Henan Academy of Crops Molecular Breeding, Henan Academy of Agricultural Sciences/National Centre for Plant Breeding/Zhengzhou Subcenter of National Soybean Improvement Center/Key Laboratory of Oil Crops in Huanghuaihai Plains of Ministry of Agriculture, Zhengzhou, China) ,  Zhang Hui (Henan Academy of Crops Molecular Breeding, Henan Academy of Agricultural Sciences/National Centre for Plant Breeding/Zhengzhou Subcenter of National Soybean Improvement Center/Key Laboratory of Oil Crops in Huanghuaihai Plains of Ministry of Agriculture, Zhengzhou, China) ,  Wang Jinshe (Henan Academy of Crops Molecular Breeding, Henan Academy of Agricultural Sciences/National Centre for Plant Breeding/Zhengzhou Subcenter of National Soybean Improvement Center/Key Laboratory of Oil Crops in Huanghuaihai Plains of Ministry of Agriculture, Zhengzhou, China) ,  Lu Weiguo (Henan Academy of Crops Molecular Breeding, Henan Academy of Agricultural Sciences/National Centre for Plant Breeding/Zhengzhou Subcenter of National Soybean Improvement Center/Key Laboratory of Oil Crops in Huanghuaihai Plains of Ministry of Agriculture, Zhengzhou, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 13  ページ： 860034  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ダイズシストセンチュウ(SCN;HeteroderaグリシンIchinohe)は世界的にダイズ生産のための高度に破壊的な病原体である。耐性品種の使用は収量損失を防ぐ最も効果的な方法である。Handou10は望ましい農業形質とSCN耐性を有する市販ダイズ品種であるが,品種におけるSCN耐性の根底にある遺伝子は未知である。Zheng9525(感受性)とHandou10の間の交雑に由来するF_2:8組換え近交系(RIL)個体群を開発し,SCN HG型2.5.7(レース1)と1.2.5.7(レース2)に対する耐性を同定した。付加的影響を有する7つの量的形質遺伝子座(QTLs)を同定した。これらのうち,染色体7,8,および18上の3つのQTLは,両品種に耐性であった。これらのQTLはSCNの雌指数の表現型変異の1.91~7.73%を説明することができた。染色体8および18上のQTLは既に報告されており,それぞれrhg1およびRhg4遺伝子座と重複していた。しかし,染色体7上のQTLは新規であった。3つのQTLの候補遺伝子を,Handou10対Zheng9525の感染根の遺伝子機能分析とトランスクリプトーム解析により予測した。トランスクリプトーム分析はまた,植物-病原体相互作用がHandou10のSCN耐性に重要な役割を果たすことを示した。情報はSCN耐性遺伝子クローニングを促進し,新規耐性遺伝子はSCNに対するダイズ耐性を改善する源になるであろう。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *解析 ,  *遺伝子 ,  *ダイズ ,  交雑 ,  品種 ,  病原体 ,  *遺伝学実験技術 ,  個体群 ,  遺伝子クローニング ,  量的形質遺伝子座 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： Heterodera ,  *トランスクリプトーム解析 ,  耐性遺伝子 ,  *候補遺伝子 ,  組換近交系 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ダイズ ,  ダイズシストセンチュウ抵抗性 ,  候補遺伝子 ,  QTL ,  全ゲノム再シークエンシング ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 豆類  (FC03035U) ,  線虫による植物被害  (FC04073L)

引用文献 (50件)：

• Abdelmajid K., Ramos L., Hyten D., Bond J., Bendahmane A., Arelli P. R., et al (2014). Quantitative trait loci (QTL) that underlie SCN resistance in soybean [Glycine max (L.) Merr.] PI438489B by ‘Hamilton’ recombinant inbred line (RIL) population. Atlas J. Plant Biol. 1 29-38. doi: 10.5147/ajpb.2014.0140
• Alkharouf N., Khan R., Matthews B. (2004). Analysis of expressed sequence tags from roots of resistant soybean infected by the soybean cyst nematode. Genome 47 380-388. doi: 10.1139/g03-114
• Chang H. X., Lipka A. E., Domier L. L., Hartman G. L. (2016). Characterization of disease resistance loci in the USDA soybean germplasm collection using genome-wide association studies. Phytopathology 106 1139-1151. doi: 10.1094/PHYTO-01-16-0042-FI
• Chen Y. X., Chen Y. S., Shi C. M., Huang Z. B., Zhang Y., Li S. K., et al (2018). SOAPnuke: a MapReduce acceleration-supported software for integrated quality control and preprocessing of high-throughput sequencing data. GigaScience 7 1-6. doi: 10.1093/gigascience/gix120
• Concibido V. C., Diers B. W., Arelli P. R. (2004). A decade of QTL mapping for cyst nematode resistance in soybean. Crop Sci. 44 1121-1131. doi: 10.2135/cropsci2004.1121

タイトルに関連する用語 (6件)： ゲノム ,  トランスクリプトーム解析 ,  ダイズシストセンチュウ ,  抵抗性 ,  候補遺伝子 ,  同定