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J-GLOBAL ID：202202275589671948   整理番号：22A1026063

比較ゲノムは持続性Staphylococcus aureus感染におけるクローン不均一性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative Genomic Reveals Clonal Heterogeneity in Persistent Staphylococcus aureus Infection

著者 (9件)： Klein Sabrina (1Department of Infectious Diseases, Medical Microbiology and Hygiene, Heidelberg University Hospital, Heidelberg, Germany) ,  Morath Benedict (2Hospital Pharmacy, Heidelberg University Hospital, Heidelberg, Germany) ,  Morath Benedict (3Cooperation Unit Clinical Pharmacy, Heidelberg University, Heidelberg, Germany) ,  Weitz Daniel (4Department of Cardiac Surgery, Heidelberg University Hospital, Heidelberg, Germany) ,  Schweizer Patrick A. (5Department of Cardiology, University Hospital Heidelberg, Heidelberg, Germany) ,  Saehr Aline (1Department of Infectious Diseases, Medical Microbiology and Hygiene, Heidelberg University Hospital, Heidelberg, Germany) ,  Heeg Klaus (1Department of Infectious Diseases, Medical Microbiology and Hygiene, Heidelberg University Hospital, Heidelberg, Germany) ,  Boutin Sebastien (1Department of Infectious Diseases, Medical Microbiology and Hygiene, Heidelberg University Hospital, Heidelberg, Germany) ,  Nurjadi Dennis (1Department of Infectious Diseases, Medical Microbiology and Hygiene, Heidelberg University Hospital, Heidelberg, Germany)
資料名： Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Web)  (Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Web))
巻： 12  ページ： 817841  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7063A  ISSN： 2235-2988  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Staphylococcus aureusによる持続的感染は,臨床上の課題のままである。感染持続性,治療成功,およびS.aureusによるこれらのタイプの感染における臨床転帰に影響する病原体の適応機構はこれまで完全には解明されていない。持続的S.aureus感染から検索した15分離株について全ゲノム配列決定法を適用し,それらの遺伝的関連性,virulome,およびレジストームを決定した。ゲノムデータの解析は,全ての分離株が共通のクローン起源を共有したが,病原性因子および抗菌剤耐性の不均一な組成を示した。この不均一性は,リファンピシンに対する表現型抗菌剤耐性およびオキサシリンの異なる最小阻害濃度と関係したrpoB遺伝子の異なる変異により反映された。さらに,分離株の1つのグループは,スタフィロキナーゼ(sak)とブドウ球菌補体阻害剤(scn)をコードする遺伝子を獲得し,溶血素b(hlb)遺伝子の切断をもたらした。これらの特徴は,免疫回避クラスタの遺伝子を運ぶS.aureusの温帯ファージに特徴的であり,hlb遺伝子への統合により三重変換を与える。免疫回避機構の調節は生物膜形成能の有意差によって示され,一方,好中球における浸潤と細胞内生存は免疫回避クラスタの存在により一様に変化しなかった。S.aureusの温帯ファージにより運ばれる病原性因子は,異なる段階での感染過程に寄与し,免疫回避と病原体の持続性に影響する。結論として,比較ゲノムの応用は持続的黄色ぶどう球菌感染におけるクローン不均一性を示した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 微生物 ,  遺伝子 ,  抗細菌薬 ,  バクテリオファージ ,  表現型 ,  溶血素 ,  *黄色ぶどう球菌 ,  *ゲノム ,  クラスタ ,  温帯 ,  病原体 ,  *クローン ,  治療法 ,  持続感染
準シソーラス用語： 免疫回避 ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： Staphylococcus aureus ,  比較ゲノム ,  ファージ ,  血流感染 ,  デバイス関連感染 ,  免疫回避クラスタ ,  scn ,  サク

分類 (3件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (44件)：

• Albano M., Karau M. J., Greenwood-Quaintance K. E., Osmon D. R., Oravec C. P., Berry D. J., et al. (2019). In Vitro Activity of Rifampin, Rifabutin, Rifapentine, and Rifaximin Against Planktonic and Biofilm States of Staphylococci Isolated From Periprosthetic Joint Infection. Antimicrob. Agents Chemother. 63 (11), e00959-19. doi: doi: 10.1128/AAC.00959-19
• Arndt D., Grant J. R., Marcu A., Sajed T., Pon A., Liang Y., et al. (2016). PHASTER: A Better, Faster Version of the PHAST Phage Search Tool. Nucleic Acids Res. 44, W16-W21. doi: doi: 10.1093/nar/gkw387
• Aubry-Damon H., Soussy C. J., Courvalin P. (1998). Characterization of Mutations in the rpoB Gene That Confer Rifampin Resistance in Staphylococcus Aureus. Antimicrob. Agents Chemother. 42, 2590-2594. doi: doi: 10.1128/AAC.42.10.2590
• Bankevich A., Nurk S., Antipov D., Gurevich A. A., Dvorkin M., Kulikov A. S., et al. (2012). SPAdes: A New Genome Assembly Algorithm and Its Applications to Single-Cell Sequencing. J. Comput. Biol. 19, 455-477. doi: doi: 10.1089/cmb.2012.0021
• Boyle-Vavra S., Jones M., Gourley B. L., Holmes M., Ruf R., Balsam A. R., et al. (2011). Comparative Genome Sequencing of an Isogenic Pair of USA800 Clinical Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus Isolates Obtained Before and After Daptomycin Treatment Failure. Antimicrob. Agents Chemother. 55, 2018-2025. doi: doi: 10.1128/AAC.01593-10

タイトルに関連する用語 (6件)： 比較ゲノム ,  持続性 ,  Staphylococcus ,  感染 ,  クローン ,  不均一性