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J-GLOBAL ID：202202275741548971   整理番号：22A1023110

宇宙曝露したKombucha微生物コミュニティメンバーKomagataeibacter oboedienは,地球上の再活性化後のゲノムのマイナー変化のみを示す【JST・京大機械翻訳】

The Space-Exposed Kombucha Microbial Community Member Komagataeibacter oboediens Showed Only Minor Changes in Its Genome After Reactivation on Earth

著者 (26件)： Santana de Carvalho Daniel (Laboratory of Molecular and Computational Biology of Fungi, Department of Microbiology, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Institute of Biological Sciences, Federal University of Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Santana de Carvalho Daniel (Laboratory of Cellular and Molecular Genetics, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Trovatti Uetanabaro Ana Paula (Laboratory of Molecular and Computational Biology of Fungi, Department of Microbiology, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Institute of Biological Sciences, Federal University of Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Trovatti Uetanabaro Ana Paula (Postgraduate Program in Biology and Biotechnology of Microorganisms, Department of Biological Sciences, State University of Santa Cruz, Ilheus, Brazil) ,  Kato Rodrigo Bentes (Laboratory of Molecular and Computational Biology of Fungi, Department of Microbiology, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Institute of Biological Sciences, Federal University of Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Kato Rodrigo Bentes (Laboratory of Cellular and Molecular Genetics, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Aburjaile Flavia Figueira (Laboratory of Cellular and Molecular Genetics, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Jaiswal Arun Kumar (Laboratory of Cellular and Molecular Genetics, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Profeta Rodrigo (Laboratory of Cellular and Molecular Genetics, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  De Oliveira Carvalho Rodrigo Dias (Laboratory of Cellular and Molecular Genetics, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Tiwar Sandeep (Laboratory of Cellular and Molecular Genetics, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Cybelle Pinto Gomide Anne (Laboratory of Cellular and Molecular Genetics, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Almeida Costa Eduardo (Computational Biology and Biotechnological Information Management Center (NBCGIB), State University of Santa Cruz, Ilheus, Brazil) ,  Kukharenko Olga (Institute of Molecular Biology and Genetics of NASU, Kyiv, Ukraine) ,  Orlovska Iryna (Institute of Molecular Biology and Genetics of NASU, Kyiv, Ukraine) ,  Podolich Olga (Institute of Molecular Biology and Genetics of NASU, Kyiv, Ukraine) ,  Reva Oleg (Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Centre for Bioinformatics and Computational Biology, University of Pretoria, Pretoria, South Africa) ,  Ramos Pablo Ivan P. (Center for Data and Knowledge Integration for Health (CIDACS), Institute Goncalo Moniz, Oswaldo Cruz Foundation (FIOCRUZ-Bahia), Salvador, Brazil) ,  De Carvalho Azevedo Vasco Ariston (Laboratory of Cellular and Molecular Genetics, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Brenig Bertram (Institute of Veterinary Medicine, Burckhardtweg, University of Gottingen, Gottingen, Germany) ,  Andrade Bruno Silva (Laboratory of Bioinformatics and Computational Chemistry, Department of Biological Sciences, State University of Southwest Bahia (UESB), Jequie, Brazil) ,  de Vera Jean-Pierre P. (German Aerospace Center (DLR) Berlin, Institute of Planetary Research, Planetary Laboratories, Astrobiological Laboratories, Berlin, Germany) ,  Kozyrovska Natalia O. (Institute of Molecular Biology and Genetics of NASU, Kyiv, Ukraine) ,  Barh Debmalya (Laboratory of Cellular and Molecular Genetics, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil) ,  Barh Debmalya (Centre for Genomics and Applied Gene Technology, Institute of Integrative Omics and Applied Biotechnology, Purba Medinipur, India) ,  Goes-Neto Aristoteles (Laboratory of Molecular and Computational Biology of Fungi, Department of Microbiology, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Institute of Biological Sciences, Federal University of Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 13  ページ： 782175  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Komagataeibacterは,Kombucha微生物共同体(KMC)における優勢な分類群とセルロース産生細菌である。これは再活性化宇宙曝露KMC試料からK.oboediensゲノムを分離し,包括的に特性化する最初の研究である。宇宙曝露ゲノムを地球ベース参照ゲノムと比較し,長期にわたって地球外条件下でK.oboediensのゲノム安定性を理解した。著者らの結果は,K.oboediens IMBG180(地上試料)とK.oboediens IMBG185(空間曝露)のゲノムがトポロジー,ゲノムアイランド,トランスポザーゼ,プリオン様蛋白質,およびプラスミドとCRISPR-Casカセットの数において著しく類似していることを示唆する。それにもかかわらず,プラスミドの長さとcas遺伝子の位置には差異があった。蛋白質コード遺伝子の数に小さな差異が観察された。これらの違いにもかかわらず,それらはセルロース合成,窒素固定,ホパノイド脂質生合成,およびストレス関連経路の遺伝的代謝プロファイルに影響しない。マイナー変化は,中心炭水化物とエネルギー代謝経路遺伝子数または配列完全性でのみ観察される。まとめると,これらの知見はK.oboediensがKMC生物膜の防御的役割によりおそらく宇宙環境に曝露されたKMCにおけるゲノム安定性と機能性を維持することを示唆する。さらに,その影響を受けない代謝経路により,この細菌種は宇宙応用に対するいくつかの有望な可能性を保持する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 位相幾何学 ,  セルロース ,  *地球 ,  細菌 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  エネルギー代謝 ,  *ゲノム ,  代謝経路 ,  プラスミド ,  *宇宙空間 ,  生物膜 ,  プリオン ,  トランスポザーゼ
準シソーラス用語： *再活性化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 比較ゲノミクス ,  Acetaceae科 ,  代謝再構築 ,  単一ヌクレオチド変異 ,  窒素固定 ,  ホパノイド ,  セルロース生合成

分類 (3件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  動物に対する影響  (EE04040K)

引用文献 (81件)：

• Andrés-Barrao C., Falquet L., Calderon-Copete S. P., Descombes P., Pérez R. O., Barja F. (2011). Genome sequences of the high-acetic acid-resistant bacteria Gluconacetobacter europaeus LMG 18890T and G. europaeus LMG 18494 (reference strains), G. europaeus 5P3, and Gluconacetobacter oboediens 174Bp2 (isolated from vinegar). J. Bacteriol. 193 2670-2671. doi: 10.1128/JB.00229-11
• Araujo F. A., Barh D., Silva A., Guimarães L., Ramos R. T. J. (2018). GO FEAT: a rapid web-based functional annotation tool for genomic and transcriptomic data. Sci. Rep. 8:1794. doi: 10.1038/s41598-018-20211-9
• Arnold K., Bordoli L., Kopp J., Schwede T. (2006). The SWISS-MODEL workspace: a web-based environment for protein structure homology modelling. Bioinformatics 22 195-201. doi: 10.1093/bioinformatics/bti770
• Arredondo-Alonso S., Bootsma M., Hein Y., Rogers M. R., Corander J., Willems R. J., et al (2020). gplas: a comprehensive tool for plasmid analysis using short-read graphs. Bioinformatics 36 3874-3876. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa233
• Bankevich A., Nurk S., Antipov D., Gurevich A. A., Dvorkin M., Kulikov A. S., et al (2012). SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J. Comput. Biol. 19 455-477. doi: 10.1089/cmb.2012.0021

タイトルに関連する用語 (11件)： 宇宙 ,  曝露 ,  Kombucha ,  微生物 ,  コミュニティ ,  メンバー ,  Komagataeibacter ,  地球 ,  再活性化 ,  ゲノム ,  マイナー