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J-GLOBAL ID：202202275863733174   整理番号：22A1160852

Humpty Dumptyは再び戻る:ボトムアッププロテオミクスにおいて蛋白質定量化は何を意味するか?【JST・京大機械翻訳】

Putting Humpty Dumpty Back Together Again: What Does Protein Quantification Mean in Bottom-Up Proteomics?

著者 (10件)： Plubell Deanna L. (Department of Genome Sciences, University of Washington, Washington, United States) ,  Kaell Lukas (Science for Life Laboratory, KTH - Royal Institute of Technology, Sweden) ,  Webb-Robertson Bobbie-Jo (Pacific Northwest National Laboratory, Washington, United States) ,  Bramer Lisa M. (Pacific Northwest National Laboratory, Washington, United States) ,  Ives Ashley (Proteomics Center of Excellence & Departments of Chemistry and Molecular Biosciences, Northwestern University, Illinois, United States) ,  Kelleher Neil L. (Proteomics Center of Excellence & Departments of Chemistry and Molecular Biosciences, Northwestern University, Illinois, United States) ,  Smith Lloyd M. (Department of Chemistry, University of Wisconsin-Madison, Wisconsin, United States) ,  Montine Thomas J. (Department of Pathology, Stanford University, California, United States) ,  Wu Christine C. (Department of Genome Sciences, University of Washington, Washington, United States) ,  MacCoss Michael J. (Department of Genome Sciences, University of Washington, Washington, United States)
資料名： Journal of Proteome Research  (Journal of Proteome Research)
巻： 21  号： 4  ページ： 891-898  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1632A  ISSN： 1535-3893  CODEN： JPROBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ボトムアッププロテオミクスはペプチド測定を提供し,プロテオミクスを大規模分析に移動させるのに貴重である。共通して,蛋白質推定または節約後の蛋白質群へのペプチド量の凝集により,各蛋白質コード遺伝子に対する単一定量値を報告した。しかしながら,RNAスプライシングと翻訳後蛋白質修飾の両方の複雑性を考えると,特異蛋白質コード遺伝子にマップする全てのペプチドが,同じ定量的応答を示すと仮定することは,過度に単純化される。蛋白質コード配列からのすべてのペプチドは同じ蛋白質の代表であると仮定することにより,重要な生物学的差異の発見を誤るかもしれない。既存のプロテオフォームの寄与を捉えるために,蛋白質コード遺伝子当たり単一量に蛋白質値を凝集する実践を再考する必要がある。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 簡素化 ,  定量分析 ,  生物学 ,  ペプチド ,  遺伝子 ,  *タンパク質 ,  *プロテオミクス ,  翻訳後修飾
準シソーラス用語： 複雑性 ,  *ボトムアップ ,  定量的プロテオミクス ,  *蛋白質定量 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 定量的プロテオミクス ,  プロテオフォーム ,  翻訳後修飾 ,  定量分析 ,  蛋白質グルーピング

分類 (3件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  有機化合物の物理分析  (CC03034A) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (4件)： ボトムアップ ,  プロテオミクス ,  蛋白質定量 ,  意味