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J-GLOBAL ID：202202275963574540   整理番号：22A1179960

直接完全長RNA配列決定は,中国の軟殻カメにおける性転換中のエピジェネティックスの重要な役割を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Direct Full-Length RNA Sequencing Reveals an Important Role of Epigenetics During Sexual Reversal in Chinese Soft-Shelled Turtle

著者 (8件)： Zhou Tong (1Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Science, Wuhan, China) ,  Chen Guobin (1Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Science, Wuhan, China) ,  Chen Guobin (2College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai, China) ,  Chen Meng (1Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Science, Wuhan, China) ,  Wang Yubin (1Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Science, Wuhan, China) ,  Wang Yubin (2College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai, China) ,  Zou Guiwei (1Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Science, Wuhan, China) ,  Liang Hongwei (1Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Science, Wuhan, China)
資料名： Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web)  (Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web))
巻： 10  ページ： 876045  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7062A  ISSN： 2296-634X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 性二形性は,中国の軟殻カメ(Pelodiscus sinensis)の重要な特徴である。雄(M)は,より広いカリップとより速い成長のため,メス(F)より高いエコノスミック価値を持つ。エストラジオールおよびメチルテストステロンのような外因性ホルモンは,遺伝子型を変えることなく,新しい表現型(偽雌,PF;偽雄,PM)を形成するために性的反転を誘発することができる。性的反転を誘発する可能性は水産養殖育種において特に重要であるが,根底にある生物学的メカニズムは不明である。ここでは,P.sinensisにおけるトランスクリプトームの複雑性を研究するために,Oxford Nanopore Technologiesを用いた超長読取による直接RNA配列決定法を適用した。4つの性型(M,F,PF,およびPM)のナノポア配列決定は,読取長と遺伝子発現の分布が,同じsex遺伝子型より同じ性表現型の間でより類似していることを示した。M表現型を持つカメと比較して,オルタナティブスプライシングは,特に代替3′スプライス部位,代替5′スプライス部位,および代替第1エキソンにおいて,Fカメにおいてより顕著であった。さらに,2つのRNAメチル化修飾m5Cとm6Aは,コード配列領域でより多くの修飾部位を持つM型で,性表現型にわたって異なって分布していたが,3′UTR領域におけるより少ない修飾部位を有した。濃縮m6A RNAの定量分析は,Odf2,Pacs2,およびAk1のN6メチル化レベルがM表現型個体で有意に高いことを明らかにしたが,Ube2oのN6メチル化レベルはMとF表現型の両方からの性反転後に減少した。まとめると,これらの知見は,中国の軟殻カメの性転換時のエピジェネティックな重要な役割を明らかにする。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 定量分析 ,  生物学 ,  メチル化 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子型 ,  表現型 ,  育種 ,  養殖 ,  雌性 ,  選択的スプライシング ,  トランスクリプトーム ,  *エピジェネティクス ,  ステロイド ,  エノン ,  脂環式アルコール ,  脂環式ケトン ,  エストロゲン ,  ステロイドホルモン ,  フェノール類 ,  ジオール
準シソーラス用語： スプライス部位 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： RNAメチル化 ,  ナノポア配列決定 ,  エピジェネティクス ,  中国の軟殻カメ ,  性転換プロセス

分類 (2件)： 魚類  (FH02020K) ,  増養殖の技術  (FH04020Y)

物質索引 (2件)： メチルテストステロン ,  エストラジオール

引用文献 (64件)：

• BalthazartJ., CornilC. A., CharlierT. D., TaziauxM., BallG. F. (2009). Estradiol, a Key Endocrine Signal in the Sexual Differentiation and Activation of Reproductive Behavior in Quail. J. Exp. Zool. 311A (5), 323-345. doi: 10.1002/jez.464
• BayegaA., OikonomopoulosS., GregoriouM.-E., TsoumaniK. T., GiakountisA., WangY. C., et al (2021). Nanopore Long-Read RNA-Seq and Absolute Quantification Delineate Transcription Dynamics in Early Embryo Development of an Insect Pest. Sci. Rep. 11 (1), 7878. doi: 10.1038/s41598-021-86753-7
• ByrneA., BeaudinA. E., OlsenH. E., JainM., ColeC., PalmerT., et al (2017). Nanopore Long-Read RNAseq Reveals Widespread Transcriptional Variation Among the Surface Receptors of Individual B Cells. Nat. Commun. 8, 16027. doi: 10.1038/ncomms16027
• CarvalhoL. B. d., BuruscoK. K., JaimeC., VenâncioT., CarvalhoA. F. S. d., MurgasL. D. S., et al (2018). Complexes between Methyltestosterone and β-cyclodextrin for Application in Aquaculture Production. Carbohydr. Polym. 179, 386-393. doi: 10.1016/j.carbpol.2017.09.023
• CredendinoS. C., NeumayerC., CantoneI. (2020). Genetics and Epigenetics of Sex Bias: Insights from Human Cancer and Autoimmunity. Trends Genet. 36 (9), 650-663. doi: 10.1016/j.tig.2020.06.016

タイトルに関連する用語 (6件)： RNA ,  中国 ,  カメ ,  性転換 ,  エピジェネティックス ,  役割