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J-GLOBAL ID：202202276093813302   整理番号：22A0888508

微生物二次代謝産物の非爆発性富:Sphingobacteriaceaeの事例研究【JST・京大機械翻訳】

The Unexplored Wealth of Microbial Secondary Metabolites: the Sphingobacteriaceae Case Study

著者 (5件)： Figueiredo Goncalo (CESAM and Department of Biology, University of Aveiro, Aveiro, Portugal) ,  Gomes Margarida (CESAM and Department of Biology, University of Aveiro, Aveiro, Portugal) ,  Covas Claudia (CESAM and Department of Biology, University of Aveiro, Aveiro, Portugal) ,  Mendo Sonia (CESAM and Department of Biology, University of Aveiro, Aveiro, Portugal) ,  Caetano Tania (CESAM and Department of Biology, University of Aveiro, Aveiro, Portugal)
資料名： Microbial Ecology  (Microbial Ecology)
巻： 83  号： 2  ページ： 470-481  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4733A  ISSN： 0095-3628  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 二次代謝産物(SMs)に関する研究は,主にグラム陽性細菌,特にActinobacteriaに集中している。ゲノムと堅牢なバイオインフォマティクスツールとの会合は,新しいSMの有望な供給源としてグラム陰性菌の無視された可能性を明らかにした。科Sphingobacteriaceaeは,ヒト,根圏,土壌,廃水を含む,実際にすべての環境で代表されるBacteroidetes門に属する。このファミリーのいくつかの属は,植物成長促進剤,バイオ修復剤およびカロチノイドや抗菌剤のような付加価値化合物の生産者として大きな可能性を示した。しかし,今日まで,SphingobacteriaceaeのSMsはまだ十分に特性化されておらず,同様に,それらの化学についてはほとんど知られていない。本研究は,Sphingobacteriaceae panゲノムが85株にわたって分布する合計446生合成遺伝子クラスター(BGC)をコードすることを明らかにし,この細菌ファミリーのSMs.Pedobacter,MucilaginibacterおよびSphingobacteriumの生産は,特にリボソーム合成および翻訳後修飾ペプチド(RiPP),テルペン,ポリケチドおよび非リボソームペプチド(NRP)の生合成をコード化している,BGCsの最も高い数を有する属であった。”ことを明らかにした。”Pedobacter,MucilaginibacterおよびSphingobacteriumは,BGCsの最も高い数を有する属であった,特にリボソーム合成および翻訳後修飾ペプチド(RiPPs),テルペン,ポリケチドおよび非リボソームペプチド(NRPs)の生合成をコード化した。MucilaginibacterおよびSphingobacterium属において,M.lappiensis ATCC BAA-1855,Mucilaginibacter sp.OK098(11のBGC)およびSphingobacterium sp.21(6BGC)は,最も高い数のBGCを有する菌株である。これら2つの属で見出された大部分のBGCは,MIBiGデータベースによる有意なヒットを持たなかった。これらの結果は,これらの化合物,特にRiPPs,PKs及びNRPsの生物活性及び環境機能はまだ知られていないことを示唆する。RiPPsの間で,2つの属はクラスIとクラスIIIランチペプチドの生産をコード化した。最後のものは,脱水機構がさらなる調査に値する珍しいリアーゼドメインを有するLanKC蛋白質と関連している。本研究は,未知の化学,生物活性およびより重要な,未知の生態学的役割を有する代謝産物を生産するための環境グラム陰性菌の巨大な可能性を明らかにする機能的情報にゲノムを翻訳した。グラフ抽象;Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  ペプチド ,  抗細菌薬 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  グラム陰性菌 ,  グラム陽性菌 ,  ゲノム ,  放線菌類 ,  生物活性 ,  リボソーム ,  *事例研究 ,  ロバスト性 ,  *二次代謝産物
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： バクテロイデト ,  Mucilaginibacter ,  Sphingobacterium ,  抗SMASH ,  ゲノムマイニング ,  BiG-SCAPE

分類 (2件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  土壌生物  (FB04050N)

タイトルに関連する用語 (5件)： 微生物 ,  二次代謝産物 ,  爆発性 ,  Sphingobacteriaceae ,  研究