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J-GLOBAL ID:202202276604606871   整理番号:22A1178730

膵臓腺癌のゲノム不安定性に関連するLncRNA予後シグネチャの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of LncRNA Prognostic Signature Associated With Genomic Instability in Pancreatic Adenocarcinoma
著者 (10件):
資料名:
巻: 12  ページ: 799475  発行年: 2022年 
JST資料番号: U7089A  ISSN: 2234-943X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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背景:ゲノム不安定性(GI)は,膵臓腺癌(PAAD)の発生および発達で重要な役割をする癌の重要な特徴である。長い非コードRNA(LncRNA)はGIの調節に関与するので,新たな予後バイオマーカーである。最近,研究者は,このようなGI関連LncRNA(GILncRNA)を用い,癌患者に対する予後シグネチャを確立し,患者の全予後の予測を助けた。しかし,PAAD患者は,GILncRNAで構築されたそのような予後徴候をまだ欠いていることは明白である。方法:本研究は,PAAD患者83名からGILncRNAをスクリーニングした。予後関連GILncRNAを単変量Cox回帰分析により同定した。これらのGILncRNAの相関係数を多変量Cox回帰分析によって得て,署名を構築するために使用した。本研究では,生存分析,変異相関解析,独立予後分析,および訓練セットにおける臨床層別分析を通して,本研究におけるシグネチャを評価し,試験ならびにすべてのTCGAセットにおいて検証した。本研究では,シグネチャの外部臨床関連検証を行い,in vitro実験を用いてPAADに対するGILncSigにおけるAC108134.2の効果を検証した。最後に,遺伝子オントロジー濃縮分析に依存するGILncRNAシグネチャ(GILncSig)の機能を調べ,化学療法薬感受性分析も行った。結果:この研究の結果は,合計409のGILncRNAが同定され,そのうちの5つが,本研究での予後リスク署名を構成し,すなわち,AC095057.3,AC10814.2,AC124798.1,AL606834.1,およびAC104695.4であった。という事を見出した。”結論]本研究の結果は,その内5つが本研究における予後リスクシグネチャーを構成することを見出した,その内の5つは,AC095057.3,AC10814.2,AC124798.1,AL606834.1,およびAC104695.4であった。本研究のシグネチャは,全生存の予測において他者よりも良好で,年齢,性別,および腫瘍グレードのPAAD患者に適用された。さらに,GSE102238における現在の研究のシグネチャは,PAAD患者の腫瘍長および腫瘍ステージと相関することが注目された。in vitroで,AC108134.2がPAADゲノム不安定性と進行と関連することを検証するために,機能的実験を本研究で使用した。特に,本研究におけるpRRophetic分析の結果は,高リスク群が逆特性を有し,化学療法に感受性であることを示した。結論:結論として,本研究で使用したGILncSigは良好な予後性能を有することが明らかになった。したがって,署名はPAAD化学療法の潜在的感受性生物学的指標になる可能性があり,それは癌患者の臨床意思決定および管理に役立つ可能性がある。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
分類
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分子遺伝学一般  ,  生物学的機能  ,  腫ようの化学・生化学・病理学 
引用文献 (63件):
  • Siegel RL, Miller KD, Jemal A. Cancer Statistics 2020. CA Cancer J Clin (2020) 70(1):7-30. doi: doi: 10.3322/caac.21590
  • Ferlay J, Partensky C, Bray F. More Deaths From Pancreatic Cancer Than Breast Cancer in the EU by 2017. Acta Oncol (2016) 55(9-10):1158-60. doi: doi: 10.1080/0284186X.2016.1197419
  • Ben-David U, Beroukhim R, Golub TR. Genomic Evolution of Cancer Models: Perils and Opportunities. Nat Rev Cancer (2019) 19(2):97-109. doi: doi: 10.1038/s41568-018-0095-3
  • O'Hagan RC, Chang S, Maser RS, Mohan R, Artandi SE, Chin L, et al. Telomere Dysfunction Provokes Regional Amplification and Deletion in Cancer Genomes. Cancer Cell (2002) 2(2):149-55. doi: doi: 10.1016/s1535-6108(02)00094-6
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