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J-GLOBAL ID：202202276758791550   整理番号：22A1178517

肺腺癌における免疫表現型に関連する遺伝子調節ネットワークにおけるコアとしてのKLRC3によるマルチオミクスデータ同定鍵遺伝子の統合解析【JST・京大機械翻訳】

Integrative Analysis of Multi-Omics Data-Identified Key Genes With KLRC3 as the Core in a Gene Regulatory Network Related to Immune Phenotypes in Lung Adenocarcinoma

著者 (11件)： Mao Kai (1Cardiovascular Surgery Department, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Mao Kai (2Research Center of Clinical Medicine, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Zhao Yunxi (3Department of Neurology, Rugao People’s Hospital, Nantong, China) ,  Ding Bo (1Cardiovascular Surgery Department, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Ding Bo (2Research Center of Clinical Medicine, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Feng Peng (4Neurosurgery, Shaanxi Provincial People’s Hospital, Shaanxi, China) ,  Li Zhenqing (1Cardiovascular Surgery Department, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Li Zhenqing (2Research Center of Clinical Medicine, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Zhou You Lang (2Research Center of Clinical Medicine, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Xue Qun (1Cardiovascular Surgery Department, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Xue Qun (2Research Center of Clinical Medicine, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 810193  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近の研究では,PD-1阻害剤は臨床試験で広く使用されており,様々な癌を改善することが示されている。しかし,PD-1/PD-L1阻害剤は,低い応答率を示し,少数の癌患者のみに効果的であった。したがって,免疫療法の低応答率に関する課題を明らかにすることが重要である。ここでは,異なる免疫細胞浸潤状態,予後および生物学的作用に従い,3種類のクラスター(クラスターA,BおよびC)を同定するため,ssGSEAおよび教師なしクラスター分析を行った。それらの中で,クラスターCは,TおよびB細胞シグナル受容体を含む多様な免疫活性経路の濃縮により,より良い生存率,より高い免疫細胞浸潤および免疫療法効果を示した。加えて,それは免疫サブタイプC2とC3に関連したより有意な特徴を示した。さらに,WGCNA分析を用いてクラスターC関連遺伝子を確認した。免疫活性化モジュールはクラスターCの111遺伝子と高度に相関した。SD/PDおよびCR/PR患者における候補遺伝子を選別するために,著者らは,より良好な予後,活性化免疫関連経路およびより良い免疫療法を有する標的を同定するために,最小絶対収縮(LASSO)およびSVM-RFEアルゴリズムを使用した。最後に,著者らの分析は,より大きな有効性とより良好な予後で免疫療法応答を効率的に改善することができるコアとしてKLRC3を有する6つの遺伝子があり,著者らの研究は免疫療法のより高い応答率に関連する標的遺伝子に関するさらなる研究のための手がかりを提供した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  *遺伝子 ,  受容体 ,  臨床試験 ,  クラスタ ,  生存率 ,  クラスタ分析 ,  免疫療法 ,  予後 ,  *肺腫瘍 ,  *腺癌 ,  細胞浸潤
準シソーラス用語： *肺腺癌 ,  癌患者 ,  標的遺伝子 ,  候補遺伝子 ,  免疫活性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 肺腺癌 ,  PD-1阻害剤 ,  LASSO分析とSVM-RFE ,  免疫細胞浸潤 ,  TCGA

分類 (2件)： 腫ようの薬物療法  (GE03032C) ,  基礎腫よう学一般  (GE02010R)

引用文献 (28件)：

• AyersM., LuncefordJ., NebozhynM., MurphyE., LobodaA., KaufmanD. R., et al (2017). IFN-γ-related mRNA Profile Predicts Clinical Response to PD-1 Blockade. J. Clin. Invest. 127 (8), 2930-2940. doi: 10.1172/jci91190
• BarberD. L., WherryE. J., MasopustD., ZhuB., AllisonJ. P., SharpeA. H., et al (2006). Restoring Function in Exhausted CD8 T Cells during Chronic Viral Infection. Nature 439, 682-687. doi: 10.1038/nature04444
• BindeaG., MlecnikB., TosoliniM., KirilovskyA., WaldnerM., ObenaufA. C., et al (2013). Spatiotemporal Dynamics of Intratumoral Immune Cells Reveal the Immune Landscape in Human Cancer. Immunity 39, 782-795. doi: 10.1016/j.immuni.2013.10.003
• BrahmerJ. R., TykodiS. S., ChowL. Q. M., HwuW.-J., TopalianS. L., HwuP., et al (2012). Safety and Activity of Anti-PD-L1 Antibody in Patients with Advanced Cancer. N. Engl. J. Med. 366, 2455-2465. doi: 10.1056/nejmoa1200694
• ChanM. H., Kleinschmidt-DemastersB. K., DonsonA. M., BirksD. K., ForemanN. K., RushS. Z. (2012). Pediatric Brainstem Gangliogliomas Show Overexpression of Neuropeptide Prepronociceptin (PNOC) by Microarray and Immunohistochemistry. Pediatr. Blood Cancer 59 (7), 1173-1179. doi: 10.1002/pbc.24232

タイトルに関連する用語 (9件)： 肺腺癌 ,  免疫表現型 ,  遺伝子調節ネットワーク ,  コア ,  マルチオミクス ,  同定 ,  鍵 ,  遺伝子 ,  統合解析