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J-GLOBAL ID：202202276762244115   整理番号：22A1025218

肝細胞癌におけるLINC00665とそのペプチドCIP2A-BPの機構解析【JST・京大機械翻訳】

Mechanism Analysis of LINC00665 and Its Peptides CIP2A-BP in Hepatocellular Carcinoma

著者 (5件)： Li Yi-Ran (Department of Intensive Care Medicine, Eastern Hepatobiliary Surgery Hospital, The Third Affiliated Hospital of Naval Medical University, Shanghai, China) ,  Zong Rui-Qing (Department of Intensive Care Medicine, Eastern Hepatobiliary Surgery Hospital, The Third Affiliated Hospital of Naval Medical University, Shanghai, China) ,  Zhang Hong-Yan (Department of Intensive Care Medicine, Eastern Hepatobiliary Surgery Hospital, The Third Affiliated Hospital of Naval Medical University, Shanghai, China) ,  Meng Xiao-Yan (Department of Intensive Care Medicine, Eastern Hepatobiliary Surgery Hospital, The Third Affiliated Hospital of Naval Medical University, Shanghai, China) ,  Wu Fei-Xiang (Department of Intensive Care Medicine, Eastern Hepatobiliary Surgery Hospital, The Third Affiliated Hospital of Naval Medical University, Shanghai, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 861096  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:より多くの研究は,長い非コードRNA(lncRNA)が短いペプチドに翻訳できるミニチュアなオープンリーディングフレームを有することを示した。ここで,著者らは肝細胞癌(HCC)における長い非コード遺伝子LINC00665とその短いペプチド(CIP2A-BP)を同定し,それらがHCC進行にどのように寄与するかを調査する。材料と方法:第1に,GSE101728データを差次的発現遺伝子(DEG)の同定のために遺伝子発現Omnibusを通して獲得し,遺伝子セット濃縮分析(GSEA)を濃縮生物学的経路を見つけるために実施した。次に,更なるバイオインフォマティクス解析を,スクリーニングされた長い非コード遺伝子に関して行い,そして,LINC00665発現を,HCCおよび正常肝臓サンプルにおいて検出した。LINC00665発現,HCC予後および臨床的特徴の間の関係を検討した。受信者動作特性(ROC)分析も,HCC予後におけるLINC00665予測を検証するために適用した。さらに,LINC00665とCIP2A-BPに関する適切な実験も行い,HCCの進行におけるそれらの役割を調べた。結果:結果として,130のアップレギュレートと202の下方制御されたDEGを含む全部で332のDEGをスクリーニングした。これらのDEGは主に遺伝子発現,RNAプロセシング,核小体および遺伝子サイレンシングの生物学的経路の転写後調節に富んでいた。さらに,LINC00665はHCC試料で増加し,その予後不良を示した。正常組織と比較して,LINC00665は,病理学的ステージIIIとIV,腫瘍フリーグループ,60歳以上の人々,およびステージT3,T4,N0,N1,およびM1においてより高い発現があった。ROC曲線は,可変INC00665が全生存(OS)の予測において一定の精度を有することを示した。さらに,機能的実験において,LINC00665ノックダウンはHCC細胞増殖,移動および浸潤を有意に減少させ,一方,過剰発現CIP2A-BPはHCC細胞増殖,浸潤および移動を著しく増加させた。結論:著者らの知見は,LINC00665によりコードされたCIP2A-BPがHCC発癌を促進するユニークな機構を明らかにするだけでなく,これらの長い非コード遺伝子および短いペプチドがHCC診断およびHCC治療の予後および新しい標的のためのバイオマーカーとして使用できることを示唆する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生物学 ,  *ペプチド ,  遺伝子 ,  発癌 ,  細胞増殖 ,  予後 ,  遺伝子発現 ,  *肝細胞癌 ,  バイオマーカー ,  遺伝子サイレンシング
準シソーラス用語： 非翻訳RNA ,  オープンリーディングフレーム ,  予後不良 ,  過剰発現 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 肝細胞癌 ,  LINC00665 ,  CIP2A-BP ,  バイオマーカー ,  生物学的情報分析

分類 (5件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  消化器の腫よう  (GH04000D) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  臨床腫よう学一般  (GE03010Y)

引用文献 (30件)：

• AnanthakrishnanA., GogineniV., SaeianK. (2006). Epidemiology of Primary and Secondary Liver Cancers. Semin. Intervent Radiol. 23 (1), 47-63. doi: 10.1055/s-2006-939841
• AndrewsS. J., RothnagelJ. A. (2014). Emerging Evidence for Functional Peptides Encoded by Short Open reading Frames. Nat. Rev. Genet. 15 (3), 193-204. doi: 10.1038/nrg3520
• BoisvertF.-M., van KoningsbruggenS., NavascuésJ., LamondA. I. (2007). The Multifunctional Nucleolus. Nat. Rev. Mol. Cel Biol. 8 (7), 574-585. doi: 10.1038/nrm2184
• BoschF. X., RibesJ., BorràsJ. (1999). Epidemiology of Primary Liver Cancer. Semin. Liver Dis. 19 (3), 271-285. doi: 10.1055/s-2007-1007117
• BoschF. X., RibesJ., DíazM., ClériesR. (2004). Primary Liver Cancer: Worldwide Incidence and Trends. Gastroenterology 127 (5), S5-S16. doi: 10.1053/j.gastro.2004.09.011

タイトルに関連する用語 (4件)： 肝細胞癌 ,  ペプチド ,  BP ,  解析