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J-GLOBAL ID：202202276766559091   整理番号：22A1114415

プローブに基づくqPCRアッセイは土壌中の殺虫剤メタアルデヒドに対する細菌分解遺伝子の迅速及び特異的検出を可能にする【JST・京大機械翻訳】

Probe-based qPCR assay enables the rapid and specific detection of bacterial degrading genes for the pesticide metaldehyde in soil

著者 (4件)： Castro-Gutierrez Victor M. (Department of Biology, University of York, Heslington, York, UK) ,  Castro-Gutierrez Victor M. (Environmental Pollution Research Center (CICA), University of Costa Rica, Montes de Oca 11501, Costa Rica) ,  Hassard Francis (Cranfield University, College Road, Cranfield, Bedfordshire MK43 0AL, UK) ,  Moir James W.B. (Department of Biology, University of York, Heslington, York, UK)
資料名： Journal of Microbiological Methods  (Journal of Microbiological Methods)
巻： 195  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： H0882A  ISSN： 0167-7012  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 軟体動物殺虫剤であるメタアルデヒドは,飲料水中の反復検出により懸念の汚染物質として同定され,それによって水ユーティリティに対する多くのコンプライアンス故障が発生する。メタアルデヒドに対する生物学的分解ポテンシャルは,異なる速度で生じる土壌に広く分布するが,今日まで,その評価のための分子的方法は報告されていない。ここでは,細菌に存在する共有金属アルデヒド分解遺伝子クラスターに属する3つの遺伝子を,土壌中の金属アルデヒド分解能を評価するための定量的PCR(qPCR)アッセイの開発の候補として使用した。遺伝子標的のスクリーニング,プライマー対及び反応条件の最適化は,土壌からmahY金属アルデヒド分解遺伝子を定量する高感度及び特異的プローブに基づくqPCR法の開発をもたらした。異なる組成と起源を有する8つの土壌でこの技術を試験した。分解経路を4/8土壌で検出し,その中で,より多くの遺伝子コピーがより大きな金属アルデヒド除去の期間と相関した。さらに,農薬の迅速な除去が,mahY遺伝子コピーの高い初期数を有する土壌で観察された。遺伝子クラスターは他の土壌では検出されず,金属アルデヒド除去も生じ,他の生物学的分解経路も本質的に重要であることを示した。ここで記述した方法は,土壌中の微生物メタアルデヒド分解の可能性と活性を推定するのに利用可能な最初のものであり,また,水浄化のための砂フィルタのようなシステムにおける分解微生物の検出や,工学プロセスにおける分解菌株をモニターするのにも使用できる。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化 ,  汚染物質 ,  *細菌 ,  *殺虫剤 ,  *アルデヒド ,  *遺伝子 ,  軟体動物 ,  浄水 ,  飲用水 ,  *土壌 ,  生物分解 ,  プライマー【遺伝】 ,  *定量的PCR法
準シソーラス用語： 遺伝子クラスタ ,  分解経路 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： qPCR ,  分解遺伝子 ,  メタアルデヒド ,  土壌 ,  農薬 ,  細菌

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (9件)： プローブ ,  qPCR ,  アッセイ ,  土壌 ,  殺虫剤 ,  メタアルデヒド ,  細菌 ,  分解 ,  遺伝子