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J-GLOBAL ID：202202276794118899   整理番号：22A0795226

生きた最小細胞のシミュレーションから出現する基本的挙動【JST・京大機械翻訳】

Fundamental behaviors emerge from simulations of a living minimal cell

著者 (16件)： Thornburg Zane R. (Department of Chemistry, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL 61801, USA) ,  Bianchi David M. (Department of Chemistry, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL 61801, USA) ,  Brier Troy A. (Department of Chemistry, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL 61801, USA) ,  Gilbert Benjamin R. (Department of Chemistry, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL 61801, USA) ,  Earnest Tyler M. (Department of Chemistry, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL 61801, USA) ,  Melo Marcelo C.R. (Department of Chemistry, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL 61801, USA) ,  Safronova Nataliya (Technische Universitaet Dresden, B CUBE Center for Molecular Bioengineering, 01307 Dresden, Germany) ,  Saenz James P. (Technische Universitaet Dresden, B CUBE Center for Molecular Bioengineering, 01307 Dresden, Germany) ,  Cook Andras T. (J. Craig Venter Institute, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Wise Kim S. (J. Craig Venter Institute, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Hutchison Clyde A. (J. Craig Venter Institute, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Smith Hamilton O. (J. Craig Venter Institute, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Glass John I. (J. Craig Venter Institute, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Luthey-Schulten Zaida (Department of Chemistry, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL 61801, USA) ,  Luthey-Schulten Zaida (NSF Center for the Physics of Living Cells, Urbana, IL 61801, USA) ,  Luthey-Schulten Zaida (NIH Center for Macromolecular Modeling and Bioinformatics, Urbana, IL 61801, USA)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 185  号： 2  ページ： 345-360.e28  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： JCVI-syn3Aの全細胞完全動的動力学モデル(WCM),少数の調節蛋白質または小RNAを保持した493遺伝子のゲノム減少を伴う最小細胞を提示した。クライオ電子トモグラムは細胞幾何学とリボソーム分布を提供する。細胞周期にわたる確率的決定論的シミュレーションからの濃度と反応フラックスの時間依存性挙動は,細胞バランスが代謝,遺伝的情報過程,および成長の如何にバランスするかを明らかにし,この最小細胞に対する生命の原則への洞察を提供する。アミノ酸,ヌクレオシドおよびイオンの活性輸送を含む各プロセスのエネルギー経済を分析した。WCMは,どのようにして緊急不均衡が転写と翻訳の速度の減速をもたらすかを明らかにする。実験データの統合は,mRNA半減期のゲノムワイド分布,qPCR結果に比較できる複数のDNA複製事象,および実験的に観察された倍加挙動を表す速度モデルの構築に重要である。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： イオン ,  幾何学 ,  *シミュレーション ,  半減期 ,  アミノ酸 ,  mRNA ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  ヌクレオシド ,  ゲノム ,  細胞周期 ,  DNA複製 ,  リボソーム ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： 低分子RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： 最小セル ,  JCVI-syn3A ,  全細胞動力学モデル ,  代謝 ,  遺伝子情報処理 ,  時間依存ATPコスト ,  mRNA半減期 ,  qPCR ,  ハイブリッド確率決定論的シミュレーション

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (3件)： 細胞 ,  シミュレーション ,  挙動