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J-GLOBAL ID：202202277257516983   整理番号：22A0847004

米国,北Californiaからの絶滅危惧ナパ偽インジゴAmorpha californica var.napensis Jeps.1925(マメ科)の完全葉緑体ゲノム【JST・京大機械翻訳】

The complete chloroplast genome of the threatened Napa False Indigo Amorpha californica var. napensis Jeps. 1925 (Fabaceae) from Northern California, USA

著者 (31件)： Hartnell College Genomics Group ,  Agudelo Ivan D. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Aldaco Griselda (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Brito-Pizano Angel (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Chavez Kimberly G. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Cortina Karina G. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Flores Jorge (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Fuentes Alejandro (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Garcia Adam N. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Garcia Alejandro (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Gonzalez-Martinez Daniel (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Hernandez Ramos Jennifer (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Hughey Jeffery R. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Katada Fernando R. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Leon Felix A. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Lopez Maleny P. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Lopez Sandra Z. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Mendoza Aileen G. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Molina Maritta (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Muhrram Asmahan (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Ortiz-Matias Daisy (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Ortiz Tonantzin E. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Pacheco Alicia (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Patel Nandini (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Ramirez Paz M. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Scaramuzzino Jennifer L. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Soto Alexandria (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Stabler Richard A. (County of Sonoma, Santa Rosa, CA, USA) ,  Vidauri Jessica M. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Villicana Jose (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA) ,  Yhip James A. (Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA)
資料名： Mitochondrial DNA Part B  (Mitochondrial DNA Part B)
巻： 7  号： 1  ページ： 283-285  発行年： 2022年 
JST資料番号： W6006A  ISSN： 2380-2359  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Amorpha californica var.napensis Jeps.1925年,Napa偽インジゴは,北部Californiaに固有の絶滅危惧潅木である。ここでは,var.napensisのトポタイプ材料の完全な葉緑体ゲノムを組み立て,この多様性のバイオインフォマティクス,系統学および保存に寄与するように特性化した。葉緑体ゲノム(GenBank accession OK274088)は,長さで158,294塩基対(bp)であり,85の蛋白質コード,37のtRNA,8つのrRNAを含む130の遺伝子をコード化して,他のPapilionoideaeに高レベルの遺伝子シンテニーを示した。系統発生分析は,Dalbergieaeと姉妹のA.fruticosa L.とA.roemeriana Scheeleのクレードにおけるvar.napensisを完全に解決した。新しく配列決定された葉緑体ゲノムは,var.napensisとAmorpha californica Nutt.var.californicaの間の遺伝的差異が,GenBankで堆積したvar.napensisと多くの他のAmorpha spp.配列の間で観察された変異より大きいことを示した。これらのデータは,var.napensisが完全な種ランクに上昇すべきであることを示唆する。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： rRNA ,  tRNA ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  *ゲノム ,  *マメ科 ,  塩基対 ,  生物分類 ,  *生物絶滅 ,  灌木
準シソーラス用語： シンテニー ,  GenBank ,  バイオインフォマティクス ,  系統解析 ,  *葉緑体ゲノム ,  クレード , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Amorpha ,  Amorpha californica ,  Amorpha californica var.californica ,  葉緑体ゲノム ,  Papilionoideae

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 米国 ,  絶滅 ,  ナパ ,  インジゴ ,  マメ科 ,  葉緑体ゲノム