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J-GLOBAL ID:202202278454362444   整理番号:22A0551670

YTHDF1はYTHDF1-AGO2相互作用と相分離を介してmRNA分解を促進する【JST・京大機械翻訳】

YTHDF1 promotes mRNA degradation via YTHDF1-AGO2 interaction and phase separation
著者 (20件):
資料名:
巻: 55  号:ページ: e13157  発行年: 2022年 
JST資料番号: T0301A  ISSN: 0960-7722  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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目的:YTHDF1はm6Aリーダー蛋白質として知られており,YTHDF1の多くの研究はmRNA翻訳効率の調節に焦点を当てた。しかし,YTHDF1はRNA分解にも関連するが,YTHDF1はmRNA分解を調節する。液-液相分離(LLPS)は,哺乳動物細胞における膜のない区画の形成を基盤とし,LLPSとのRNA分解の相関に焦点を当てた報告はほとんどない。本研究では,LLPSを介したYTHDF1分解mRNAの機構に焦点を当てた。材料と方法:CRISPR/Cas9ノックアウトシステムを用いて,YTHDF1ノックアウト(YTHDF1-KO)細胞株(HEK293とHeLa)とMETTL14ノックアウト(METTL14-KO)細胞株(HEK293)を確立した。4SU-TT-seqを用いて,mRNAの半減期変化をチェックした。アクチノマイシンDとqPCRを用いて,個々のmRNAの半減期変化を試験した。RNAは野生型(WT)とYTHDF1-KO HeLa細胞株でSYTO RNA選択色素で染色した。YTHDF1とAGO2の共局在を免疫蛍光により同定した。YTHDF1とAGO2の相互作用ドメインをウェスタンブロットによって同定した。YTHDF1の相分離をin vitroおよびin vivoで行った。光漂白(FRAP)後の蛍光回復を,それらの流動性の評価として液滴上で行った。結果:本研究では,YTHDF1の欠失が細胞質に沈着した大量のRNAパッチをもたらすことを見出した。4SU-TT-seqの結果は,YTHDF1の欠失がmRNAの半減期を延長することを示した。免疫蛍光データはYTHDF1とAGO2がP体に共局在し,Co-IP結果はYTHDF1がYT521-B相同性(YTH)ドメインを介してAGO2と相互作用することを示した。YTHDF1はin vitroおよびin vivoで相分離をおこなうことができ,AGO2と比較して,YTHDF1はP体形成においてより重要であることを確認した。FRAPの結果は,YTHDF1が削除されたとき,液体AGO2液滴がゲル/固体に変換することを示した。AGO2はmiRISCsにおいて重要な役割を果たすので,miRNA仲介mRNA分解がYTHDF1に関連することも見出した。結論:YTHDF1はYTHドメインを介してAGO2を動員する。YTHDF1はLLPSを介してP体形成を促進することにより標的mRNAを分解した。YTHDF1の欠失はP体を液滴からゲル/固体液滴へ変化させ,AGO2/RNAパッチを形成し,mRNAの分解遅延をもたらした。これらの知見から,YTHDF1とAGO2の間の以前に認識されていないクロストークを明らかにし,YTHDF1によるmRNA転写後調節の新しい見解を提起した。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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